29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1105 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1105  H+transporting two-sector ATPase C subunit  100 
 
 		 142 aa  265  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2086  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  50 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.185721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19430  V-type ATP synthase subunit C  47.18 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0520  H+transporting two-sector ATPase C subunit  58.67 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1014  H+transporting two-sector ATPase C subunit  41.67 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3459  H+transporting two-sector ATPase C subunit  49.32 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1688  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45.71 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.422777 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0419  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  46.67 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3445  H+transporting two-sector ATPase C subunit  47.83 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0283  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  36.71 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.319058  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1613  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  44.62 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0553  V-type ATP synthase subunit K  35.94 
 
 		 222 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.651546  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1619  V-type ATP synthase subunit K  35.94 
 
 		 222 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.573628  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0294  V-type ATP synthase subunit K  35.94 
 
 		 222 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.620174 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0363  V-type ATP synthase subunit K  35.94 
 
 		 222 aa  45.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.100605  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1179  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  40 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00560744  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2681  H+transporting two-sector ATPase C subunit  40 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0243152  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  36.84 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  33.33 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  33.98 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1774  V-type ATP synthase subunit K  30.53 
 
 		 232 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0061  V-type ATP synthase subunit K  35.94 
 
 		 223 aa  42  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11649  predicted protein  32.43 
 
 		 173 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  39.51 
 
 		 606 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  32.86 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  37.88 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  37.88 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  37.88 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1218  hypothetical protein  35.53 
 
 		 83 aa  40  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000000445422  normal  0.214233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>