34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2681 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2681  H+transporting two-sector ATPase C subunit  100 
 
 		 93 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0243152  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0283  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  84.21 
 
 		 82 aa  122  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.319058  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1179  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  89.55 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00560744  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1218  hypothetical protein  72.73 
 
 		 83 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000000445422  normal  0.214233 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2349  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  83.12 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.211164 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0378  A1AO H+ ATPase subunit K  60.94 
 
 		 81 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0390  A1AO H+ ATPase subunit K  59.38 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1613  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  59.09 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1239  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  67.19 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0294  V-type ATP synthase subunit K  43.84 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.620174 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1619  V-type ATP synthase subunit K  43.84 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.573628  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0363  V-type ATP synthase subunit K  43.84 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0553  V-type ATP synthase subunit K  43.84 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.651546  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1433  A-type ATP synthase subunit K  52.54 
 
 		 68 aa  57  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1014  H+transporting two-sector ATPase C subunit  42.42 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0061  V-type ATP synthase subunit K  44.62 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.33 
 
 		 606 aa  52.4  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0520  H+transporting two-sector ATPase C subunit  42.65 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0419  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  45 
 
 		 70 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1449  H+transporting two-sector ATPase C subunit  48.53 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0399378  normal  0.449211 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0277  H+transporting two-sector ATPase C subunit  61.54 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.571155 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1774  V-type ATP synthase subunit K  46.77 
 
 		 232 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3349  hypothetical protein  55.81 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2568  H+transporting two-sector ATPase C subunit  41.94 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0859386  normal  0.3596 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  44.12 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1105  H+transporting two-sector ATPase C subunit  40 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2767  H+transporting two-sector ATPase C subunit  42.37 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000764187  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1198  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  42.37 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0357317  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2672  H+transporting two-sector ATPase C subunit  42.37 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.000356712  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1634  H+transporting two-sector ATPase C subunit  46.77 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1920  V-type ATP synthase subunit K  46.77 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.418171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1688  H+transporting two-sector ATPase C subunit  37.88 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.422777 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1613  V-type ATP synthase subunit K  39.06 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.932181  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1894  V-type ATP synthase subunit K  39.06 
 
 		 164 aa  40  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>