38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1688 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1688  H+transporting two-sector ATPase C subunit  100 
 
 		 102 aa  187  5e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.422777 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1105  H+transporting two-sector ATPase C subunit  40.62 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1014  H+transporting two-sector ATPase C subunit  46.27 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2086  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  40.24 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.185721  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0520  H+transporting two-sector ATPase C subunit  38.57 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1201  ATP synthase F0 sector, C subunit  40.38 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.539498  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  38.89 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  38.89 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  38.89 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3459  H+transporting two-sector ATPase C subunit  39.06 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  40.3 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19430  V-type ATP synthase subunit C  46.34 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  34.67 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2681  H+transporting two-sector ATPase C subunit  38.03 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0243152  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  43.86 
 
 		 606 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  32.84 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1774  V-type ATP synthase subunit K  34.04 
 
 		 232 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1281  F0F1 ATP synthase subunit C  31.73 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1179  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  37.88 
 
 		 85 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00560744  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0553  V-type ATP synthase subunit K  37.5 
 
 		 222 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.651546  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0294  V-type ATP synthase subunit K  37.5 
 
 		 222 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.620174 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1619  V-type ATP synthase subunit K  37.5 
 
 		 222 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.573628  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  37.5 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0363  V-type ATP synthase subunit K  37.7 
 
 		 222 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.100605  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1613  V-type ATP synthase subunit K  33.33 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.932181  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1894  V-type ATP synthase subunit K  33.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  37.88 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>