More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0627 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  100 
 
 		 158 aa  323  5e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  94.94 
 
 		 158 aa  310  4.999999999999999e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  94.27 
 
 		 159 aa  306  5.9999999999999995e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  93.12 
 
 		 160 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0143251 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  77.55 
 
 		 187 aa  230  6e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  61.87 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  62.5 
 
 		 140 aa  173  9e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  62.86 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  48.92 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  47.48 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  46.04 
 
 		 161 aa  140  9e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  46.04 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  48.18 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  50.75 
 
 		 140 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  50.75 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  53.17 
 
 		 141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  50.77 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  52.27 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  50.77 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  50 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  43.38 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  45.59 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  50 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  44.12 
 
 		 139 aa  113  8.999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  38.97 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  44.7 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  40.74 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  48.25 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  43.38 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  42.31 
 
 		 137 aa  106  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  40.94 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  47.2 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  38.97 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1390  30S ribosomal protein S19  52.87 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1296  30S ribosomal protein S19  52.87 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  48.84 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0957  30S ribosomal protein S19  48.31 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000875114  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  49.47 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  46.39 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  46.32 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  45.16 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1189  30S ribosomal protein S19  44.21 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0653663 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  46.51 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1134  30S ribosomal protein S19  48.28 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000887938  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  48.1 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  48.42 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0493  30S ribosomal protein S19  46.91 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0341  30S ribosomal protein S19  42.35 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.9817e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  46.84 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0760  30S ribosomal protein S19  45.35 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000341891  normal  0.0171843 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1850  30S ribosomal protein S19  42.35 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000178079  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  44.3 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  46.32 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0290  30S ribosomal protein S19  43.02 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00351648  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  47.73 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  43.01 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  46.84 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  45.57 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  45.57 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  45.57 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  44.3 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1840  ribosomal protein S19  46.88 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000159969  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0260  30S ribosomal protein S19  45.57 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0207  30S ribosomal protein S19  45.57 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  44.68 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  44.68 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  47.06 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0771  30S ribosomal protein S19  43.48 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0231426  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  46.84 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  45 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  47.06 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  46.84 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3439  30S ribosomal protein S19  46.84 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00121291  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  46.51 
 
 		 90 aa  63.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  43.68 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0854  ribosomal protein S19  41.86 
 
 		 91 aa  63.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2320  ribosomal protein S19  45.57 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000230352  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4909  30S ribosomal protein S19  44.3 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00546448  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  47.83 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  44.71 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0430  30S ribosomal protein S19  47.13 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377773  decreased coverage  0.00000532224 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  44.3 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  44.3 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  44.3 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  44.3 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  44.3 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  44.3 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  44.3 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  44.3 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  44.3 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  44.3 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  44.3 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1349  30S ribosomal protein S19  43.84 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  44.3 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  44.3 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  44.21 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  44.21 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  45.88 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  44.3 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  41.94 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>