More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4071 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
169 aa  338  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  63.31 
 
 
172 aa  235  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  51.43 
 
 
178 aa  153  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  54.26 
 
 
182 aa  147  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  51.16 
 
 
182 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.32 
 
 
187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2985  PAP2 superfamily protein  41.76 
 
 
175 aa  134  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  50 
 
 
199 aa  131  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0409  phosphoesterase, PA-phosphatase related  50.32 
 
 
170 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  49.69 
 
 
170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0785734  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  49.68 
 
 
170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  47.7 
 
 
176 aa  127  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.88 
 
 
169 aa  127  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  54.48 
 
 
170 aa  121  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.73 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.5 
 
 
170 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0435  phosphoesterase PA-phosphatase related  53.49 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.3398  hitchhiker  0.00199052 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  53.49 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0449  phosphoesterase PA-phosphatase related  54.26 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3891  phosphoesterase PA-phosphatase related  54.26 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.256491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1657  PAP2 superfamily protein  37.35 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000234418  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0510  phosphoesterase, PA-phosphatase related  52.71 
 
 
170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.03 
 
 
157 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4195  PAP2 family protein  47.26 
 
 
170 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.93 
 
 
222 aa  92  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  50.59 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2733  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.21 
 
 
172 aa  85.1  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.34 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000896993 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.3 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0139  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.29 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1897  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.25 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.06 
 
 
201 aa  77.4  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.06 
 
 
201 aa  77.4  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.77 
 
 
178 aa  77.4  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.77 
 
 
178 aa  77.4  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.05 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2304  hypothetical protein  38.35 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1816  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.56 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.17 
 
 
182 aa  73.9  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02498  PAP2 superfamily, putative  34.38 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.96 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  40 
 
 
185 aa  72  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  41.18 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.13 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.73 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.794332  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3387  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.65 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000111833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.81 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2029  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.57 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2178  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.46 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.893732  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.56 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2178  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.93 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.87 
 
 
207 aa  63.9  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.04 
 
 
279 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0369  PAP2 family protein  34.35 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636888  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4871  PAP2 family protein  34.35 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0817  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.61 
 
 
179 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4656  PAP2 family protein  34.35 
 
 
177 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4494  phosphatidylglycerophosphatase B  35.11 
 
 
177 aa  62.4  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.78 
 
 
199 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5011  PAP2 family protein  34.35 
 
 
177 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4588  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.83 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40.38 
 
 
227 aa  62.4  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4897  PAP2 family protein  35.11 
 
 
177 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4880  PAP2 family protein  34.35 
 
 
177 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.86 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4906  PAP2 family protein  35.11 
 
 
177 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.72 
 
 
202 aa  60.8  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4512  phosphatidylglycerophosphatase B  34.35 
 
 
177 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113665  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2128  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.22 
 
 
199 aa  60.8  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.167938  normal  0.900368 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.09 
 
 
205 aa  59.7  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1555  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.02 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.72 
 
 
208 aa  58.2  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0425  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.3 
 
 
209 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41159  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3147  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  41.3 
 
 
218 aa  57  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.225101  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0219  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.21 
 
 
219 aa  57  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237278 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  39.33 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  40 
 
 
438 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.11 
 
 
225 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1410  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.91 
 
 
187 aa  55.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.163391 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1412  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.85 
 
 
263 aa  55.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98368  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  42.31 
 
 
439 aa  55.5  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.04 
 
 
305 aa  54.3  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2201  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.25 
 
 
208 aa  54.3  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.77 
 
 
177 aa  54.3  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0174559  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1840  PAP2 family protein  40.45 
 
 
272 aa  53.9  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3348  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.48 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.31592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0206  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38 
 
 
239 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.456858  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.39 
 
 
438 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2560  phosphoesterase PA-phosphatase related  28 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0315  membrane-associated phospholipid phosphatase  34.02 
 
 
216 aa  53.9  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.770739  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.05 
 
 
230 aa  53.9  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1525  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.65 
 
 
249 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1037  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.35 
 
 
200 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000361007  hitchhiker  0.00000179156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3404  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.71 
 
 
228 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0918  PAP2 family protein  35.35 
 
 
200 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.791764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0430  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31 
 
 
497 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647388  normal  0.580984 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.78 
 
 
211 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  38.1 
 
 
438 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.96 
 
 
280 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>