More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2245 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
175 aa  346  9e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  78.29 
 
 
175 aa  279  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  78.29 
 
 
175 aa  278  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  76 
 
 
175 aa  277  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  76 
 
 
175 aa  272  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  73.14 
 
 
175 aa  264  5e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  78.29 
 
 
175 aa  261  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  40.8 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  40.8 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  45.56 
 
 
171 aa  134  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  40.8 
 
 
179 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  41.04 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  39.13 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  37.5 
 
 
164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  37.89 
 
 
167 aa  107  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  37.97 
 
 
164 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  35.29 
 
 
194 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  40.85 
 
 
164 aa  101  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  34.73 
 
 
171 aa  99.8  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  33.97 
 
 
168 aa  97.4  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  32.95 
 
 
172 aa  95.9  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  31.25 
 
 
162 aa  95.5  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  35.19 
 
 
206 aa  94.7  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1517  ATP synthase F0, B subunit  36.88 
 
 
165 aa  94  9e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  35.17 
 
 
164 aa  94  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  37.5 
 
 
181 aa  93.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  36.84 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  32.68 
 
 
178 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  32.54 
 
 
173 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  32.54 
 
 
173 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  32.69 
 
 
168 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  30.67 
 
 
156 aa  90.5  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  34.67 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  35.95 
 
 
156 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  29.48 
 
 
238 aa  89  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  34.93 
 
 
156 aa  89.4  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  88.6  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  88.6  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  37.25 
 
 
156 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  88.6  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  89  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  35.95 
 
 
156 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  31.41 
 
 
168 aa  88.6  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  36.18 
 
 
165 aa  87.8  8e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  38.22 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  38.22 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  38.22 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  38.22 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  38.22 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  38.22 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  39.73 
 
 
151 aa  86.3  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  38.22 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  38.22 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  31.1 
 
 
166 aa  86.7  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  37.67 
 
 
203 aa  86.3  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  38.22 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  38.22 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  32.48 
 
 
168 aa  85.5  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  35.19 
 
 
164 aa  85.5  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  35.95 
 
 
156 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
156 aa  84.7  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  33.79 
 
 
156 aa  84.7  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  30.52 
 
 
166 aa  84.7  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  36.6 
 
 
156 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  37.58 
 
 
156 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  37.58 
 
 
156 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  37.58 
 
 
156 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  37.58 
 
 
156 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  36.6 
 
 
156 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  37.58 
 
 
156 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  31.48 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  35.95 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  35.29 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  32.67 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  35.95 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  34.42 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  34.42 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  33.77 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  34.42 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  35.06 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  35.71 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  36.02 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  32.28 
 
 
159 aa  82  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  32.28 
 
 
159 aa  82  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  36.02 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  31.25 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  36.02 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  35.71 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  36.02 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  32.26 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  30.82 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  33.12 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  29.53 
 
 
163 aa  80.5  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  35.4 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>