More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1646 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1646  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
312 aa  633  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.108455  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1767  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  77.2 
 
 
349 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00166566  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0719  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.34 
 
 
308 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.778436  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2055  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.68 
 
 
311 aa  442  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545936  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0492  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.77 
 
 
301 aa  433  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0142904  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1334  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.15 
 
 
311 aa  427  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1788  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.03 
 
 
308 aa  423  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000240723  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.01 
 
 
310 aa  300  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.85 
 
 
307 aa  299  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.51 
 
 
306 aa  299  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  48.85 
 
 
307 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  50.65 
 
 
320 aa  295  7e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  50.99 
 
 
312 aa  294  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  48.68 
 
 
313 aa  293  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.16 
 
 
307 aa  293  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2268  aspartate carbamoyltransferase  49.34 
 
 
315 aa  291  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.34 
 
 
313 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.2 
 
 
312 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  50 
 
 
312 aa  290  2e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.68 
 
 
312 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.91 
 
 
307 aa  288  7e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  47.42 
 
 
311 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  46.58 
 
 
309 aa  285  5e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0612  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.99 
 
 
313 aa  285  7e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.295857  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.37 
 
 
304 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.175577  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  46.56 
 
 
312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.3 
 
 
328 aa  281  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  47.37 
 
 
305 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.62 
 
 
313 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  46.41 
 
 
309 aa  280  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0924  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.71 
 
 
344 aa  280  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.51 
 
 
308 aa  280  3e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  48.03 
 
 
313 aa  280  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.56 
 
 
323 aa  279  5e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.56 
 
 
315 aa  278  8e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  47.39 
 
 
306 aa  278  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.88 
 
 
315 aa  277  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.1 
 
 
316 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1475  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
310 aa  275  5e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0541  aspartate carbamoyltransferase  47.4 
 
 
306 aa  275  6e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000499557  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.28 
 
 
323 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0503  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.51 
 
 
312 aa  275  7e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0338301  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0941  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.22 
 
 
328 aa  275  9e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.28 
 
 
323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0327  aspartate carbamoyltransferase  47.7 
 
 
312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.92 
 
 
323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.89 
 
 
313 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.44 
 
 
310 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12660  aspartate carbamoyltransferase  47.32 
 
 
319 aa  272  5.000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0228481 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.95 
 
 
308 aa  272  5.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  45.81 
 
 
312 aa  272  6e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3190  aspartate carbamoyltransferase  46.05 
 
 
319 aa  271  7e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482997  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.56 
 
 
313 aa  271  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.9 
 
 
323 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.81 
 
 
316 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.12 
 
 
310 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  47.54 
 
 
320 aa  271  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0839  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.3 
 
 
321 aa  271  1e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.111278  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.38 
 
 
346 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.16 
 
 
315 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.54 
 
 
319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.23 
 
 
313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.81 
 
 
317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1878  aspartate carbamoyltransferase  48.85 
 
 
314 aa  269  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  46.36 
 
 
313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.19 
 
 
311 aa  269  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.38 
 
 
341 aa  269  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0757  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.38 
 
 
343 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305012 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3808  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.38 
 
 
341 aa  269  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.52 
 
 
311 aa  269  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.38 
 
 
343 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3345  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.06 
 
 
320 aa  269  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.164434  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1145  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.71 
 
 
320 aa  269  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0910  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.21 
 
 
320 aa  269  5e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297016 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2893  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.43 
 
 
320 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.43 
 
 
320 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.503342 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2521  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.38 
 
 
343 aa  268  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.191298 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0838  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.38 
 
 
343 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.677096  hitchhiker  0.0028837 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0385  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.38 
 
 
343 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0867  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.38 
 
 
343 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3965  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.38 
 
 
381 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.603902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0482  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.83 
 
 
334 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.13 
 
 
316 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1465  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.05 
 
 
343 aa  267  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981882  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1581  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.91 
 
 
320 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0602  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.52 
 
 
316 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.05 
 
 
361 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5040  aspartate carbamoyltransferase  45.83 
 
 
334 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3109  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.05 
 
 
361 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3145  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.05 
 
 
361 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1994  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.05 
 
 
343 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165088  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2749  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.05 
 
 
361 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636253  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.84 
 
 
315 aa  266  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3167  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.05 
 
 
343 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.84 
 
 
315 aa  266  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.05 
 
 
361 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.43 
 
 
313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.83 
 
 
336 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  46.15 
 
 
329 aa  266  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.08 
 
 
317 aa  265  8e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>