More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0492 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0492  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
301 aa  610  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0142904  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1334  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  77.59 
 
 
311 aa  489  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2055  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  78.11 
 
 
311 aa  483  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545936  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0719  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  75.26 
 
 
308 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.778436  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1788  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  75.84 
 
 
308 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000240723  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1767  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.43 
 
 
349 aa  424  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00166566  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1646  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.77 
 
 
312 aa  422  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.108455  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  53.93 
 
 
312 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.03 
 
 
310 aa  295  8e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  53.58 
 
 
312 aa  288  8e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.35 
 
 
307 aa  288  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  52.79 
 
 
311 aa  286  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  49.83 
 
 
312 aa  287  2e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  51 
 
 
320 aa  287  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  50.17 
 
 
313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  51.39 
 
 
307 aa  286  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  51.97 
 
 
305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.69 
 
 
307 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.64 
 
 
312 aa  280  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0941  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.34 
 
 
328 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.61 
 
 
313 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0503  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.88 
 
 
312 aa  279  5e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0338301  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.53 
 
 
308 aa  278  6e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0612  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.89 
 
 
313 aa  278  9e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.295857  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  49.82 
 
 
309 aa  276  3e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.42 
 
 
307 aa  276  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.04 
 
 
312 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.62 
 
 
308 aa  275  6e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.32 
 
 
313 aa  275  7e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  48.32 
 
 
309 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.65 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.22 
 
 
304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.175577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.65 
 
 
311 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
310 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
310 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0541  aspartate carbamoyltransferase  48.24 
 
 
306 aa  268  7e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000499557  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0924  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.8 
 
 
344 aa  268  7e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.31 
 
 
315 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0346  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.32 
 
 
321 aa  266  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419246  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1475  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.93 
 
 
310 aa  267  2e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  49.63 
 
 
320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  47.65 
 
 
312 aa  265  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.7 
 
 
328 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.97 
 
 
328 aa  265  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  48.32 
 
 
316 aa  263  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2268  aspartate carbamoyltransferase  47.44 
 
 
315 aa  264  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  48.12 
 
 
306 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0327  aspartate carbamoyltransferase  48.39 
 
 
312 aa  263  3e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  50.56 
 
 
313 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15550  aspartate carbamoyltransferase  48.5 
 
 
310 aa  263  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.31 
 
 
315 aa  263  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  48.01 
 
 
311 aa  262  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2913  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.47 
 
 
336 aa  262  6e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3190  aspartate carbamoyltransferase  47.77 
 
 
319 aa  262  6e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482997  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.93 
 
 
323 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  50.93 
 
 
306 aa  260  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0602  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.35 
 
 
316 aa  260  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02002  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.31 
 
 
312 aa  260  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05260  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.97 
 
 
334 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.873262  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0155  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.11 
 
 
309 aa  260  2e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.269734  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  47.04 
 
 
314 aa  260  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0502  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.97 
 
 
334 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.44 
 
 
313 aa  260  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2409  aspartate carbamoyltransferase  48.32 
 
 
340 aa  259  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.891458  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  47.3 
 
 
313 aa  259  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.62 
 
 
316 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2039  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.4 
 
 
309 aa  259  4e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.485925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1375  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.62 
 
 
305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.84 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  47.14 
 
 
313 aa  259  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0365  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.11 
 
 
324 aa  258  6e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.1 
 
 
313 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.55 
 
 
311 aa  258  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.7 
 
 
324 aa  258  8e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.1 
 
 
313 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3061  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.15 
 
 
341 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.280506  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.51 
 
 
317 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.63 
 
 
308 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0482  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.11 
 
 
334 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.92 
 
 
319 aa  256  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5314  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.11 
 
 
334 aa  256  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.165994  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.74 
 
 
334 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.686364  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.31 
 
 
336 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.75 
 
 
309 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2102  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.35 
 
 
317 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.75 
 
 
313 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5040  aspartate carbamoyltransferase  48.11 
 
 
334 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.44 
 
 
318 aa  256  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
316 aa  255  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3059  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.48 
 
 
327 aa  254  8e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.7 
 
 
318 aa  255  8e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.48 
 
 
327 aa  254  8e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0397  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.29 
 
 
335 aa  254  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.3 
 
 
316 aa  254  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.75 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2007  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.51 
 
 
362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3005  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.6 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0942  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.32 
 
 
316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.62 
 
 
310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>