31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02146 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02146  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  527  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0049  hypothetical protein  49.43 
 
 
265 aa  259  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.732388  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1152  hypothetical protein  48.94 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3563  aminotransferase class IV  38.39 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5090  hypothetical protein  37.72 
 
 
283 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5272  hypothetical protein  38.57 
 
 
271 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0994  hypothetical protein  40 
 
 
272 aa  141  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0184  hypothetical protein  35.29 
 
 
259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4101  hypothetical protein  34.07 
 
 
271 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0051  aminotransferase class IV  33.91 
 
 
259 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15150  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.33 
 
 
273 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784526  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3082  hypothetical protein  35.87 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2260  aminotransferase class IV  33.33 
 
 
248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00278928  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4210  hypothetical protein  29.35 
 
 
313 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2963  hypothetical protein  32.7 
 
 
283 aa  109  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3435  hypothetical protein  33.91 
 
 
281 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.38 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.83 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2355  aminotransferase class IV  24.21 
 
 
281 aa  49.3  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.6 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.17 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.7 
 
 
271 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0461  aminotransferase, class IV  25.2 
 
 
301 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.47 
 
 
271 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4154  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.52 
 
 
271 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0929284  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  20.19 
 
 
291 aa  45.8  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.81 
 
 
271 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  24.08 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1917  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.34 
 
 
271 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307364  unclonable  0.000000254306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.95 
 
 
271 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0610  aminotransferase class IV  19.74 
 
 
246 aa  42.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0570431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>