More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5417 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  100 
 
 		 242 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5576  protein serine/threonine phosphatase  90.08 
 
 		 242 aa  431  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  76.45 
 
 		 242 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  76.03 
 
 		 242 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  67.92 
 
 		 242 aa  333  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  46.41 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0146  putative phosphoprotein phosphatase  45.15 
 
 		 242 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  45.64 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.4 
 
 		 243 aa  182  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  43.83 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  45.11 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  44.07 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  44.68 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.86 
 
 		 239 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  38.4 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  36.4 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  39.66 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  35.94 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1112  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  35.4 
 
 		 217 aa  148  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  40.52 
 
 		 421 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  38.46 
 
 		 417 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  37.3 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1520  putative phosphoprotein phosphatase  32.76 
 
 		 241 aa  144  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.101947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  39.15 
 
 		 519 aa  142  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  40.25 
 
 		 463 aa  141  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  37.02 
 
 		 441 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  37.93 
 
 		 394 aa  138  7.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  36.21 
 
 		 425 aa  137  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  32.47 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  36.6 
 
 		 234 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  39.01 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  36.09 
 
 		 395 aa  136  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  36.97 
 
 		 449 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  37.24 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  37.89 
 
 		 467 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  37.7 
 
 		 234 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  36.64 
 
 		 472 aa  135  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  35.09 
 
 		 478 aa  134  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  39.5 
 
 		 507 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  34.43 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  37.87 
 
 		 426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3136  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.71 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  34.43 
 
 		 419 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  36.13 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  36.13 
 
 		 477 aa  132  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.4 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  34.76 
 
 		 478 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.29 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  39.83 
 
 		 500 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  35.65 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.77 
 
 		 516 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  38.56 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  37.13 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  35.04 
 
 		 505 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  37.93 
 
 		 452 aa  130  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  34.16 
 
 		 264 aa  129  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  32.42 
 
 		 548 aa  129  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  36.32 
 
 		 491 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.32 
 
 		 491 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.33 
 
 		 482 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  37.87 
 
 		 474 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.77 
 
 		 517 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.32 
 
 		 491 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  36.96 
 
 		 469 aa  129  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  36.04 
 
 		 474 aa  128  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  36.02 
 
 		 462 aa  128  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  36.48 
 
 		 463 aa  128  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2458  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.45 
 
 		 258 aa  128  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  34.75 
 
 		 236 aa  128  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  36.05 
 
 		 540 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  36.47 
 
 		 435 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.44 
 
 		 280 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  37.78 
 
 		 514 aa  124  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  36.6 
 
 		 319 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  38.66 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  34.63 
 
 		 270 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  34.31 
 
 		 320 aa  123  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.18 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  36.75 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  36.44 
 
 		 325 aa  122  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  35.37 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  35.9 
 
 		 321 aa  121  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  34.89 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  33.33 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0438  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.8 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  34.75 
 
 		 466 aa  119  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  36.02 
 
 		 571 aa  119  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  32.42 
 
 		 597 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.47 
 
 		 238 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  28.34 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  37.66 
 
 		 479 aa  118  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  35.15 
 
 		 449 aa  118  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  31.33 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.6 
 
 		 438 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.3 
 
 		 611 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  32.26 
 
 		 574 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  32.1 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  32.14 
 
 		 386 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21560  serine/threonine protein phosphatase  36.64 
 
 		 293 aa  116  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146725  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  31.3 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>