More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3107 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  70.93 
 
 
533 aa  751  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63016  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0793  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  63.08 
 
 
521 aa  654  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.599853 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1535  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  69.63 
 
 
526 aa  718  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  6.73423e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1146  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.09 
 
 
521 aa  660  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.337025 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.02 
 
 
523 aa  662  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1324  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  76.25 
 
 
518 aa  789  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0640975  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3255  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  80.96 
 
 
520 aa  847  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0354  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  63.13 
 
 
515 aa  635  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0217  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  79.62 
 
 
521 aa  828  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3518  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.02 
 
 
528 aa  668  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4221  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  75.72 
 
 
529 aa  800  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.054716 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04761  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  62.24 
 
 
522 aa  637  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0658  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  63.9 
 
 
531 aa  674  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0627  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  63.9 
 
 
531 aa  674  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0830  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.35 
 
 
522 aa  660  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0747  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  63.3 
 
 
524 aa  653  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.501154  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0666  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  68.71 
 
 
535 aa  719  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0756  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  68.71 
 
 
535 aa  717  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0800  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.6 
 
 
525 aa  673  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3223  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.99 
 
 
525 aa  675  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  63.44 
 
 
521 aa  664  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3500  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  71.71 
 
 
532 aa  755  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393361  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01720  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  79.23 
 
 
521 aa  824  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.452845 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4090  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  70.93 
 
 
533 aa  751  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3326  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.41 
 
 
525 aa  674  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0618  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  62.93 
 
 
520 aa  650  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.309291 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  68.27 
 
 
521 aa  724  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1376  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  67.24 
 
 
522 aa  692  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  70.69 
 
 
532 aa  729  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2881  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  69.56 
 
 
518 aa  691  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00897132  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1091  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.48 
 
 
535 aa  651  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2094  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  75.43 
 
 
523 aa  790  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0848  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  63.83 
 
 
528 aa  666  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3639  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.02 
 
 
528 aa  667  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5071  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  69.36 
 
 
518 aa  706  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.132309 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4496  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  71.48 
 
 
532 aa  757  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783992  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0688  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  73.26 
 
 
530 aa  753  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242332  normal  0.621191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0692  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  63.9 
 
 
531 aa  674  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.766507  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3612  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  73.65 
 
 
519 aa  751  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3445  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  64.02 
 
 
528 aa  667  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2368  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  69.75 
 
 
518 aa  693  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0331686  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26320  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  76.58 
 
 
521 aa  796  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1814  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  70.44 
 
 
523 aa  727  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4055  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  70.99 
 
 
524 aa  734  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3453  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  63.41 
 
 
522 aa  680  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455545  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00564  hypothetical protein  63.9 
 
 
521 aa  674  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3573  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  64.62 
 
 
520 aa  666  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.158044  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3729  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  64.42 
 
 
520 aa  662  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21210  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  63.46 
 
 
523 aa  686  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0675992  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3926  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  65.19 
 
 
520 aa  670  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001043  alkyl hydroperoxide reductase protein F  62.81 
 
 
522 aa  640  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.30284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04590  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  73.9 
 
 
530 aa  746  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3942  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  70.99 
 
 
524 aa  734  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  0.781405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3533  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  80.58 
 
 
520 aa  842  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.463079  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4879  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  71.37 
 
 
529 aa  727  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3037  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  63.9 
 
 
531 aa  674  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0627  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  63.9 
 
 
531 aa  674  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3186  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  81.54 
 
 
520 aa  848  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0929  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  64.16 
 
 
522 aa  661  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0870  subunit F of alkyl hydroperoxide reductase  70.08 
 
 
531 aa  723  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.037495  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3433  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  70.55 
 
 
533 aa  753  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0259  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  68.79 
 
 
527 aa  695  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00384538 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1403  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  64.99 
 
 
525 aa  675  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3983  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  71.29 
 
 
532 aa  756  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170234  normal  0.309156 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0782  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  70.46 
 
 
531 aa  726  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0983751  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3656  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  71.24 
 
 
530 aa  759  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425396  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0520  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  63.9 
 
 
531 aa  674  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5402  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  72.39 
 
 
530 aa  756  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  1.00097e-05  normal  0.196114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2999  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  66.15 
 
 
525 aa  711  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.336504  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0630  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  69.69 
 
 
520 aa  709  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.663768  normal  0.219895 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0246  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  70.79 
 
 
524 aa  732  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0118696  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1206  AhpF  71.76 
 
 
530 aa  749  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.914e-10  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0956  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  64.8 
 
 
527 aa  676  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3018  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  63.9 
 
 
531 aa  674  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.531369  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3518  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II, active site  70.44 
 
 
521 aa  736  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.401893  hitchhiker  0.00190824 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1196  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  68.67 
 
 
518 aa  710  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  4.20739e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2924  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase class-II  85.96 
 
 
520 aa  897  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2044  alkyl hydroperoxide reductase subunit  68.71 
 
 
622 aa  717  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4716  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  62.31 
 
 
523 aa  644  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3045  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  70.75 
 
 
523 aa  729  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1927  alkyl hydroperoxide reductase subunit  70.44 
 
 
601 aa  734  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.586969  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3011  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.12 
 
 
531 aa  648  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II, active site  70.29 
 
 
519 aa  729  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1954  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  71.32 
 
 
532 aa  751  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0428675  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1417  thioredoxin-disulfide reductase  72.67 
 
 
526 aa  747  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2440  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  80.96 
 
 
520 aa  847  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2974  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  98.08 
 
 
520 aa  1046  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250232  normal  0.0117128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3107  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  100 
 
 
520 aa  1059  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00119955  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00575  alkyl hydroperoxide reductase, F52a subunit, FAD/NAD(P)-binding  63.9 
 
 
521 aa  674  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03190  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  59.36 
 
 
560 aa  630  1e-179  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2811  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  60.15 
 
 
538 aa  623  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  3.04525e-07 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0943  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  60.39 
 
 
509 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1067  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  60.11 
 
 
535 aa  620  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1964  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.95 
 
 
509 aa  620  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0448  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  60.47 
 
 
509 aa  618  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0391  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  60.66 
 
 
508 aa  610  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4927  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  60.47 
 
 
508 aa  608  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640436  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0438  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  60.66 
 
 
508 aa  609  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0376  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  60.66 
 
 
508 aa  609  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1243  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  61.05 
 
 
517 aa  610  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>