More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0800 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2440  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  65.18 
 
 
520 aa  676    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2999  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  59.42 
 
 
525 aa  647    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.336504  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4716  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  67.56 
 
 
523 aa  701    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0956  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  97.15 
 
 
527 aa  1016    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3107  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  64.6 
 
 
520 aa  673    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00119955  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5402  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  65.05 
 
 
530 aa  679    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000100097  normal  0.196114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3255  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  64.8 
 
 
520 aa  674    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0830  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  82.15 
 
 
522 aa  859    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0217  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  64.67 
 
 
521 aa  669    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2974  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.8 
 
 
520 aa  676    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250232  normal  0.0117128 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4496  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  63.62 
 
 
532 aa  679    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783992  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3518  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II, active site  64.48 
 
 
521 aa  664    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.401893  hitchhiker  0.00190824 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3186  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  65.57 
 
 
520 aa  674    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0756  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  62.48 
 
 
535 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04590  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  62.26 
 
 
530 aa  641    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3983  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  63.29 
 
 
532 aa  675    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170234  normal  0.309156 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2044  alkyl hydroperoxide reductase subunit  62.81 
 
 
622 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2924  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase class-II  65.38 
 
 
520 aa  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0666  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  62.81 
 
 
535 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0618  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  78.99 
 
 
520 aa  830    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.309291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1954  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.01 
 
 
532 aa  669    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0428675  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1324  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.09 
 
 
518 aa  668    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0640975  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3518  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  92.05 
 
 
528 aa  975    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0793  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  83.56 
 
 
521 aa  857    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.599853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1417  thioredoxin-disulfide reductase  65.76 
 
 
526 aa  676    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04761  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  64.55 
 
 
522 aa  659    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1927  alkyl hydroperoxide reductase subunit  63.85 
 
 
601 aa  665    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.586969  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II, active site  63.57 
 
 
519 aa  662    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3612  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  62.6 
 
 
519 aa  638    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  93.71 
 
 
523 aa  984    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653172  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2811  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  61.27 
 
 
538 aa  656    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000304525 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1196  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.55 
 
 
518 aa  657    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000420739  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0848  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  91.48 
 
 
528 aa  970    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1206  AhpF  65.18 
 
 
530 aa  679    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001914  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3011  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  79.85 
 
 
531 aa  853    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0688  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  64.02 
 
 
530 aa  671    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242332  normal  0.621191 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0354  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  66.41 
 
 
515 aa  674    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3639  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  91.86 
 
 
528 aa  973    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.16 
 
 
532 aa  644    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.2 
 
 
533 aa  672    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63016  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3433  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  63.48 
 
 
533 aa  674    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4221  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.03 
 
 
529 aa  664    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.054716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1067  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  69.04 
 
 
535 aa  722    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0782  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  61.21 
 
 
531 aa  645    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0983751  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3533  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  64.6 
 
 
520 aa  670    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.463079  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0800  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
525 aa  1073    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3223  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  98.86 
 
 
525 aa  1062    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3656  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  64.85 
 
 
530 aa  682    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425396  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  80.19 
 
 
521 aa  849    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2094  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  63.32 
 
 
523 aa  660    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3500  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  63.67 
 
 
532 aa  673    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393361  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01720  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  64.29 
 
 
521 aa  666    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.452845 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21210  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  59.46 
 
 
523 aa  642    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0675992  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  61.27 
 
 
521 aa  654    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4879  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  63.71 
 
 
529 aa  646    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0929  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  82.46 
 
 
522 aa  853    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001043  alkyl hydroperoxide reductase protein F  64.55 
 
 
522 aa  665    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.30284  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0747  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  81.24 
 
 
524 aa  855    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.501154  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0870  subunit F of alkyl hydroperoxide reductase  61.21 
 
 
531 aa  645    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.037495  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4090  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.2 
 
 
533 aa  672    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3326  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  97.52 
 
 
525 aa  1018    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3445  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  91.86 
 
 
528 aa  975    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1403  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  61.36 
 
 
525 aa  634  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0259  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  62.17 
 
 
527 aa  632  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00384538 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26320  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  61.58 
 
 
521 aa  634  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0246  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  61.9 
 
 
524 aa  630  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0118696  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1814  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  61.24 
 
 
523 aa  630  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1535  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  60.27 
 
 
526 aa  630  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000673423  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0630  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  61.17 
 
 
520 aa  630  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.663768  normal  0.219895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5071  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  61.2 
 
 
518 aa  629  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.132309 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4055  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  60.54 
 
 
524 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3942  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  60.54 
 
 
524 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  0.781405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3045  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  59.81 
 
 
523 aa  618  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00575  alkyl hydroperoxide reductase, F52a subunit, FAD/NAD(P)-binding  58.8 
 
 
521 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3018  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  58.8 
 
 
531 aa  617  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.531369  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0627  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  58.8 
 
 
531 aa  617  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0627  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  58.8 
 
 
531 aa  617  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00564  hypothetical protein  58.8 
 
 
521 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0692  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  58.8 
 
 
531 aa  617  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.766507  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0520  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  58.8 
 
 
531 aa  617  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0658  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  58.8 
 
 
531 aa  617  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03190  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  57.81 
 
 
560 aa  618  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1376  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  61.12 
 
 
522 aa  616  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3037  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  58.8 
 
 
531 aa  617  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1964  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.86 
 
 
509 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2881  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  61.39 
 
 
518 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00897132  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2368  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  61 
 
 
518 aa  608  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0331686  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3453  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  58.61 
 
 
522 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455545  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0943  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  58.4 
 
 
509 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0391  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  58.4 
 
 
508 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2518  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  59.18 
 
 
509 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4927  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  58.01 
 
 
508 aa  600  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640436  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1146  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.03 
 
 
521 aa  600  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.337025 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0314  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.59 
 
 
508 aa  599  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0167284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0438  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  58.01 
 
 
508 aa  598  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0439  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  57.81 
 
 
508 aa  596  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.6667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0313  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  57.81 
 
 
508 aa  596  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0316  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  57.81 
 
 
508 aa  597  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0324  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.01 
 
 
508 aa  596  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0344  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  57.81 
 
 
508 aa  596  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>