58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5172 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  289  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  95.21 
 
 
149 aa  275  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  57.72 
 
 
177 aa  174  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  56.38 
 
 
174 aa  172  2e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  59.18 
 
 
182 aa  164  3e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  53.02 
 
 
175 aa  157  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  43.71 
 
 
181 aa  120  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  47.45 
 
 
144 aa  117  4e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  36.99 
 
 
184 aa  107  4e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  38.37 
 
 
206 aa  107  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  41.38 
 
 
165 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  41.84 
 
 
167 aa  100  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  40 
 
 
167 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  38.85 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  41.26 
 
 
165 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  37.34 
 
 
178 aa  88.6  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2198  hypothetical protein  40.97 
 
 
159 aa  87.8  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  36.96 
 
 
155 aa  84  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  31.08 
 
 
174 aa  66.6  1e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  28.57 
 
 
153 aa  63.5  9e-10  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  31.58 
 
 
162 aa  63.2  1e-09  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  33.1 
 
 
178 aa  62  2e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  30.19 
 
 
163 aa  61.6  3e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  27.52 
 
 
200 aa  57.8  5e-08  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  33.11 
 
 
151 aa  56.2  1e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  28 
 
 
158 aa  56.2  1e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  31.2 
 
 
160 aa  52.8  1e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  32.33 
 
 
148 aa  52.8  2e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  31.94 
 
 
147 aa  52.8  2e-06  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  29.49 
 
 
189 aa  52.8  2e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  8.5919e-08  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  31.82 
 
 
158 aa  52.4  2e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  32.33 
 
 
148 aa  52.8  2e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  32.33 
 
 
148 aa  51.2  4e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2235  MOSC domain-containing protein  32.89 
 
 
144 aa  51.2  4e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0302  MOSC  35.48 
 
 
146 aa  50.8  6e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2483  hypothetical protein  32.26 
 
 
179 aa  50.1  9e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0431097  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  33.63 
 
 
189 aa  50.1  1e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  37.61 
 
 
164 aa  50.1  1e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  26.95 
 
 
145 aa  48.9  2e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  1.72861e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  26.95 
 
 
145 aa  49.3  2e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  26.95 
 
 
145 aa  49.3  2e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.03173e-05 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0913  MOSC domain containing protein  34.48 
 
 
143 aa  47  9e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  28.47 
 
 
190 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  28.57 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  26.47 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  27.74 
 
 
190 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2403  MOSC domain-containing protein  30.77 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524087  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  28.87 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  25.74 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  30.53 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  31.45 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  26.9 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  29.08 
 
 
197 aa  41.6  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  26.9 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0255  MOSC domain containing protein  30.34 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1093  MOSC domain containing protein  28.57 
 
 
234 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1157  hypothetical protein  29.25 
 
 
241 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  26.21 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>