115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5279 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5279  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  248  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5189  protein of unknown function DUF861, cupin_3  98.32 
 
 		 119 aa  246  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  0.130139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5331  protein of unknown function DUF861 cupin_3  98.32 
 
 		 119 aa  245  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0191  protein of unknown function DUF861 cupin_3  96.64 
 
 		 119 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  78.15 
 
 		 121 aa  203  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0236  protein of unknown function DUF861, cupin_3  75.63 
 
 		 119 aa  202  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  77.78 
 
 		 122 aa  200  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5535  hypothetical protein  73.95 
 
 		 120 aa  197  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70170  hypothetical protein  74.79 
 
 		 120 aa  196  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6090  hypothetical protein  73.95 
 
 		 120 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6639  protein of unknown function DUF861 cupin_3  63.87 
 
 		 120 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  58.82 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3205  protein of unknown function DUF861 cupin_3  57.98 
 
 		 121 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  61.86 
 
 		 121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  57.98 
 
 		 121 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  57.98 
 
 		 121 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  60.34 
 
 		 128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  57.14 
 
 		 121 aa  160  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000597126  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1042  protein of unknown function DUF861, cupin_3  59.66 
 
 		 127 aa  158  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284329  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  56.3 
 
 		 121 aa  158  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  56.3 
 
 		 121 aa  158  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  57.14 
 
 		 119 aa  158  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  60.68 
 
 		 120 aa  157  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  54.62 
 
 		 124 aa  153  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  57.26 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  52.99 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  51.26 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  50.45 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  47.41 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  46.96 
 
 		 120 aa  124  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  46.55 
 
 		 123 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  46.02 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  42.86 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  44.44 
 
 		 113 aa  88.6  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.94 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.05 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0821  hypothetical protein  33.62 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.79703  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1755  hypothetical protein  38.05 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  31.93 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1330  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.91 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0401  protein of unknown function DUF861, cupin_3  42.71 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4007  hypothetical protein  32.5 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1243  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.09 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2907  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.21 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.65 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  39.56 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  39.56 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0697  hypothetical protein  40.45 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.895833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1693  hypothetical protein  32.11 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  40.66 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  39.56 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  40.66 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.56 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.33 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.66 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.56 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.56 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.56 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.56 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2742  hypothetical protein  31.48 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.48 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.48 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.56 
 
 		 114 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  38.2 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.11 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7505  hypothetical protein  30.43 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0745  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.17 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4966  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.53 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0418481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.4 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5674  hypothetical protein  30.43 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1516  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.53 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.63 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.838844 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5197  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.44 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.58 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.919827  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.57 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2785  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5000  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.31 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.88 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  30 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  31.88 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  34.29 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  30 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.43 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1631  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.31 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.43 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.43 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1704  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.82 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2618  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.17 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.813991  normal  0.532352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0621  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.14 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3083  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.84 
 
 		 296 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  30.77 
 
 		 115 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15631  hypothetical protein  30.95 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0714  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.88 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.729837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1469  hypothetical protein  28.05 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.278748  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.38 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15781  hypothetical protein  29.76 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0779  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.44 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0364385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>