More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1908 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1908  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 		 329 aa  667    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000305573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  99.09 
 
 		 329 aa  661    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1484  signal peptide peptidase SppA, 36K type  97.26 
 
 		 329 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1519  signal peptide peptidase SppA, 36K type  87.1 
 
 		 341 aa  594  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  78.72 
 
 		 329 aa  544  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  73.95 
 
 		 332 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  75.99 
 
 		 326 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  73.35 
 
 		 332 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  73.86 
 
 		 326 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  73.25 
 
 		 326 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  73.39 
 
 		 325 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  63.37 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0925  peptidase S49  61.19 
 
 		 321 aa  360  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.474149 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  55.74 
 
 		 316 aa  346  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1622  putative peptidase  55.19 
 
 		 329 aa  344  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.270373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  52.87 
 
 		 312 aa  328  6e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  52.9 
 
 		 313 aa  322  8e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  52.92 
 
 		 378 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2009  peptidase S49  49.84 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  53.42 
 
 		 325 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  51.75 
 
 		 330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4227  peptidase S49  52.38 
 
 		 330 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2436  peptidase S49  51.13 
 
 		 387 aa  302  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  51.64 
 
 		 325 aa  301  8.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1073  peptidase S49  52.38 
 
 		 330 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476485  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0635  peptidase S49  52.38 
 
 		 330 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1115  peptidase S49  52.38 
 
 		 330 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  50.68 
 
 		 364 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  52.17 
 
 		 333 aa  299  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1356  peptidase S49  50.99 
 
 		 311 aa  299  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  50.68 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2271  peptidase S49  50.97 
 
 		 394 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0995  peptidase S49  51.42 
 
 		 330 aa  295  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  50.98 
 
 		 333 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0991  peptidase S49  51.1 
 
 		 330 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  50.71 
 
 		 327 aa  292  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  52.58 
 
 		 333 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0524  peptidase, U7 family protein  52.58 
 
 		 333 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  52.58 
 
 		 333 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2915  peptidase  52.58 
 
 		 333 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0641289  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  52.58 
 
 		 333 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  52.58 
 
 		 333 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  49.68 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0822  peptidase S49  50.46 
 
 		 336 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1066  family S49 unassigned peptidase  48.76 
 
 		 334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  47.73 
 
 		 350 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  51.03 
 
 		 361 aa  281  9e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46 
 
 		 350 aa  280  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.3 
 
 		 357 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  49.66 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1193  peptidase S49  47.53 
 
 		 321 aa  278  8e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.200797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  53.06 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0399  peptidase S49  45.03 
 
 		 313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.673483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  51.54 
 
 		 340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1428  peptidase S49  45.25 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574443 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1713  hypothetical protein  44.13 
 
 		 318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1713  hypothetical protein  44.13 
 
 		 318 aa  269  4e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2918  peptidase S49  48.75 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  52.73 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0786  signal peptide peptidase  46.1 
 
 		 351 aa  266  4e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2639  peptidase S49  49.69 
 
 		 347 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3286  peptidase S49  50.16 
 
 		 347 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0792  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.43 
 
 		 351 aa  265  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4784  peptidase S49  47.92 
 
 		 323 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5278  peptidase S49  52.4 
 
 		 348 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1382  peptidase S49  43.2 
 
 		 347 aa  251  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  45.75 
 
 		 315 aa  249  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.62 
 
 		 339 aa  242  7.999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1737  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.65 
 
 		 354 aa  239  5e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391092  normal  0.794877 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1240  peptidase S49  48.35 
 
 		 316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1144  peptidase S49  38.97 
 
 		 312 aa  232  7.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.148766  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0098  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.72 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2084  signal peptide peptidase  38.72 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3922  peptidase S49  42.69 
 
 		 278 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0725  peptidase S49  48.5 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0166  peptidase S49  40.15 
 
 		 297 aa  182  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  44.2 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0461  peptidase S49  48.95 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  47.37 
 
 		 368 aa  172  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  47.37 
 
 		 368 aa  172  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  50.55 
 
 		 288 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0066  peptidase S49  41.4 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0385  S49 family peptidase  41.26 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2523  peptidase S49  41.7 
 
 		 265 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  44.91 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  46.84 
 
 		 290 aa  169  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  44.44 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  44.91 
 
 		 302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  41.26 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0708  peptidase S49  43.72 
 
 		 286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884772  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  43.78 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  45.77 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0640  peptidase S49  42.79 
 
 		 265 aa  162  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  42.31 
 
 		 286 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2737  peptidase S49  38.89 
 
 		 265 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224887  normal  0.140523 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  45.6 
 
 		 286 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3297  peptidase S49  41.7 
 
 		 286 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.49449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1076  S49 family peptidase  38.49 
 
 		 265 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2757  peptidase S49  45.54 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2857  peptidase S49  40.68 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>