40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_61325 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_61325  3-keto-steroid reductase  100 
 
 		 346 aa  712    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.406154  decreased coverage  0.00397596 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05585  3-ketosteroid reductase (AFU_orthologue; AFUA_4G11500)  26.67 
 
 		 447 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03020  3-keto sterol reductase, putative  26.09 
 
 		 629 aa  89.4  8e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.67 
 
 		 327 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.07 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.95 
 
 		 320 aa  53.9  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  24.07 
 
 		 317 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.8 
 
 		 280 aa  52.8  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  19.83 
 
 		 329 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.36 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43164  predicted protein  25.14 
 
 		 298 aa  49.7  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.27 
 
 		 249 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3481  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.11 
 
 		 259 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.28 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0140794 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.18 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.84 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  19.49 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07339  conserved hypothetical protein  24.34 
 
 		 359 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.201379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  20.09 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  23.38 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.27 
 
 		 328 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  23.27 
 
 		 316 aa  46.2  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.18 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  20.35 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  26.75 
 
 		 267 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.24 
 
 		 253 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  21.67 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5176  short-chain dehydrogenase  47.73 
 
 		 254 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340709  hitchhiker  0.00401231 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10815  conserved hypothetical protein  22.4 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.7 
 
 		 250 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27381  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.37 
 
 		 265 aa  43.5  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.61 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.18 
 
 		 254 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 257 aa  43.1  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.47 
 
 		 252 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  23.85 
 
 		 257 aa  43.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 340 aa  43.1  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00109277  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.57 
 
 		 279 aa  42.7  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.85 
 
 		 255 aa  42.7  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>