30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_44719 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_44719  predicted protein  100 
 
 		 895 aa  1811    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00567496  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08291  AP-3 complex subunit delta, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03640)  29.55 
 
 		 934 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.258771  hitchhiker  0.0000000134894 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54028  predicted protein  36.61 
 
 		 1277 aa  299  2e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.214816  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42302  predicted protein  29.91 
 
 		 622 aa  291  3e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110936  hitchhiker  0.00027641 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00910  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  28.71 
 
 		 932 aa  241  4e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.752282  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01870  gamma-adaptin, putative  25.28 
 
 		 854 aa  129  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.543816  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04207  AP-1 adaptor complex subunit gamma, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06030)  22.75 
 
 		 839 aa  126  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82880  predicted protein  25.7 
 
 		 812 aa  125  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16891  predicted protein  24.58 
 
 		 450 aa  123  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39338  predicted protein  24.06 
 
 		 630 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109278  normal  0.0495163 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24457  predicted protein  22.43 
 
 		 829 aa  118  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0686631  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07016  AP-2 adaptor complex subunit alpha, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04310)  23.67 
 
 		 935 aa  106  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00660  vesicle-mediated transport-related protein, putative  21.42 
 
 		 1063 aa  91.7  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_278  predicted protein  21.38 
 
 		 971 aa  81.6  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.385886 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48152  predicted protein  21.38 
 
 		 979 aa  81.3  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0169632 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54442  predicted protein  20.14 
 
 		 1019 aa  72  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.595032  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49385  predicted protein  23.66 
 
 		 936 aa  67.4  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0497486  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91200  predicted protein  24.21 
 
 		 947 aa  60.8  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01177  Coatomer subunit beta, putative (Eurofung)  23.51 
 
 		 950 aa  60.1  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32574  predicted protein  22.08 
 
 		 981 aa  58.2  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54730  predicted protein  23.75 
 
 		 805 aa  57.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.442884  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13511  predicted protein  23.11 
 
 		 939 aa  57  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119607  Beta adaptin-like protein  23.6 
 
 		 551 aa  54.3  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02780  ER to Golgi transport-related protein, putative  22.63 
 
 		 952 aa  53.9  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.346474  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04170  vesicle-mediated transport-related protein, putative  21.58 
 
 		 696 aa  50.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.567808  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03830  clathrin binding protein, putative  23.84 
 
 		 755 aa  48.9  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03029  AP-1 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08970)  26.17 
 
 		 766 aa  48.1  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0965274 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74268  beta-adaptin, large subunit of the clathrin-associated protein (AP-1) complex  24.43 
 
 		 736 aa  48.1  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03830  clathrin binding protein, putative  24.64 
 
 		 732 aa  47.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04870  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 857 aa  45.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>