31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA01870 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_04207  AP-1 adaptor complex subunit gamma, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06030)  53.41 
 
 		 839 aa  883    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01870  gamma-adaptin, putative  100 
 
 		 854 aa  1747    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.543816  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24457  predicted protein  43.11 
 
 		 829 aa  643    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0686631  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82880  predicted protein  38.58 
 
 		 812 aa  573  1.0000000000000001e-162  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13511  predicted protein  37.47 
 
 		 939 aa  535  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00660  vesicle-mediated transport-related protein, putative  27.8 
 
 		 1063 aa  259  1e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48152  predicted protein  28.26 
 
 		 979 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0169632 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07016  AP-2 adaptor complex subunit alpha, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04310)  29.97 
 
 		 935 aa  254  5.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_278  predicted protein  29.48 
 
 		 971 aa  246  9e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.385886 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54442  predicted protein  29.39 
 
 		 1019 aa  239  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.595032  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39338  predicted protein  25.51 
 
 		 630 aa  224  4e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109278  normal  0.0495163 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16891  predicted protein  29.93 
 
 		 450 aa  212  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32574  predicted protein  23.77 
 
 		 981 aa  145  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54028  predicted protein  22.87 
 
 		 1277 aa  141  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.214816  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44719  predicted protein  25.09 
 
 		 895 aa  133  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00567496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42302  predicted protein  21.8 
 
 		 622 aa  124  8e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110936  hitchhiker  0.00027641 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08291  AP-3 complex subunit delta, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03640)  26.85 
 
 		 934 aa  122  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.258771  hitchhiker  0.0000000134894 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00910  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  25.88 
 
 		 932 aa  82.4  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.752282  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91200  predicted protein  23.56 
 
 		 947 aa  67.4  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01177  Coatomer subunit beta, putative (Eurofung)  19.44 
 
 		 950 aa  58.9  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44118  predicted protein  20.9 
 
 		 676 aa  56.2  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.139737  normal  0.0310937 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02780  ER to Golgi transport-related protein, putative  19.57 
 
 		 952 aa  55.5  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.346474  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74268  beta-adaptin, large subunit of the clathrin-associated protein (AP-1) complex  26.75 
 
 		 736 aa  55.8  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54511  predicted protein  20.85 
 
 		 978 aa  52  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03830  clathrin binding protein, putative  20 
 
 		 755 aa  51.6  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49385  predicted protein  21.55 
 
 		 936 aa  50.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0497486  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04170  vesicle-mediated transport-related protein, putative  20.67 
 
 		 696 aa  50.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.567808  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03830  clathrin binding protein, putative  23.12 
 
 		 732 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03029  AP-1 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08970)  18.2 
 
 		 766 aa  48.9  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0965274 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05710  VHS domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06680)  28.71 
 
 		 626 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0235702  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05950  AP-2 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10340)  20.51 
 
 		 717 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>