34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_03029 on replicon BN001306
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_03029  AP-1 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08970)  100 
 
 
766 aa  1578    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0965274 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74268  beta-adaptin, large subunit of the clathrin-associated protein (AP-1) complex  48.54 
 
 
736 aa  665    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03830  clathrin binding protein, putative  55.16 
 
 
732 aa  768    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03830  clathrin binding protein, putative  54.61 
 
 
755 aa  783    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04170  vesicle-mediated transport-related protein, putative  49.74 
 
 
696 aa  550  1e-155  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.567808  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119607  Beta adaptin-like protein  46.79 
 
 
551 aa  520  1e-146  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05950  AP-2 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10340)  42.42 
 
 
717 aa  494  9.999999999999999e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84899  predicted protein  33.17 
 
 
697 aa  327  5e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54730  predicted protein  29.13 
 
 
805 aa  288  2.9999999999999996e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.442884  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86921  predicted protein  29.55 
 
 
785 aa  259  1e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44118  predicted protein  27.45 
 
 
676 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.139737  normal  0.0310937 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00165  AP-3 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11360)  26.89 
 
 
841 aa  191  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.318304  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06410  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  25.2 
 
 
835 aa  171  5e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_54789  predicted protein  27.76 
 
 
1205 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88879  clathrin assembly complex beta adaptin component  22.92 
 
 
817 aa  125  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.789212 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42302  predicted protein  22.18 
 
 
622 aa  76.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110936  hitchhiker  0.00027641 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82880  predicted protein  21.51 
 
 
812 aa  65.9  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04207  AP-1 adaptor complex subunit gamma, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06030)  20.91 
 
 
839 aa  63.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00660  vesicle-mediated transport-related protein, putative  24.38 
 
 
1063 aa  60.1  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01177  Coatomer subunit beta, putative (Eurofung)  20.63 
 
 
950 aa  55.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91200  predicted protein  21.21 
 
 
947 aa  51.6  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01870  gamma-adaptin, putative  18.37 
 
 
854 aa  50.8  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.543816  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  26.3 
 
 
493 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44719  predicted protein  26.17 
 
 
895 aa  47.8  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00567496  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13511  predicted protein  20.11 
 
 
939 aa  47.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49385  predicted protein  18.12 
 
 
936 aa  46.6  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0497486  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39338  predicted protein  26.49 
 
 
630 aa  46.6  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109278  normal  0.0495163 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_278  predicted protein  22.76 
 
 
971 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.385886 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48152  predicted protein  22.76 
 
 
979 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0169632 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54028  predicted protein  20.04 
 
 
1277 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.214816  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24457  predicted protein  18.22 
 
 
829 aa  45.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0686631  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10209  predicted protein  19.77 
 
 
910 aa  45.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4513  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.71 
 
 
208 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.283819  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  31.67 
 
 
4800 aa  44.3  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>