18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54442 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_54442  predicted protein  100 
 
 		 1019 aa  2113    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.595032  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07016  AP-2 adaptor complex subunit alpha, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04310)  34.33 
 
 		 935 aa  520  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00660  vesicle-mediated transport-related protein, putative  38.2 
 
 		 1063 aa  443  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48152  predicted protein  35.39 
 
 		 979 aa  377  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0169632 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_278  predicted protein  34.91 
 
 		 971 aa  378  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.385886 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32574  predicted protein  25.37 
 
 		 981 aa  290  8e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01870  gamma-adaptin, putative  29.58 
 
 		 854 aa  245  3e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.543816  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04207  AP-1 adaptor complex subunit gamma, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06030)  29.17 
 
 		 839 aa  221  6e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24457  predicted protein  27.7 
 
 		 829 aa  207  7e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0686631  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82880  predicted protein  26.72 
 
 		 812 aa  180  9e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13511  predicted protein  24.6 
 
 		 939 aa  164  7e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16891  predicted protein  25.31 
 
 		 450 aa  150  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39338  predicted protein  24.7 
 
 		 630 aa  147  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109278  normal  0.0495163 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54028  predicted protein  25.06 
 
 		 1277 aa  109  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.214816  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42302  predicted protein  23.64 
 
 		 622 aa  89.4  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110936  hitchhiker  0.00027641 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08291  AP-3 complex subunit delta, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03640)  22.36 
 
 		 934 aa  86.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.258771  hitchhiker  0.0000000134894 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44719  predicted protein  20.79 
 
 		 895 aa  80.1  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00567496  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00910  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  27.54 
 
 		 932 aa  46.2  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.752282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>