21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54028 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_54028  predicted protein  100 
 
 		 1277 aa  2631    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.214816  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42302  predicted protein  35.96 
 
 		 622 aa  390  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110936  hitchhiker  0.00027641 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08291  AP-3 complex subunit delta, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03640)  33.49 
 
 		 934 aa  305  4.0000000000000003e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.258771  hitchhiker  0.0000000134894 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44719  predicted protein  33.33 
 
 		 895 aa  298  4e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00567496  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00910  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  30.66 
 
 		 932 aa  246  3e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.752282  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01870  gamma-adaptin, putative  23.13 
 
 		 854 aa  139  5e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.543816  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39338  predicted protein  24.32 
 
 		 630 aa  135  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109278  normal  0.0495163 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13511  predicted protein  22.5 
 
 		 939 aa  134  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04207  AP-1 adaptor complex subunit gamma, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06030)  22.81 
 
 		 839 aa  134  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16891  predicted protein  23.91 
 
 		 450 aa  119  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24457  predicted protein  23.59 
 
 		 829 aa  116  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0686631  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82880  predicted protein  24.35 
 
 		 812 aa  110  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48152  predicted protein  21.82 
 
 		 979 aa  108  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0169632 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_278  predicted protein  21.82 
 
 		 971 aa  108  7e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.385886 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00660  vesicle-mediated transport-related protein, putative  21.48 
 
 		 1063 aa  108  9e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07016  AP-2 adaptor complex subunit alpha, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04310)  21.85 
 
 		 935 aa  105  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54442  predicted protein  25.06 
 
 		 1019 aa  103  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.595032  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03830  clathrin binding protein, putative  19.9 
 
 		 755 aa  51.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04170  vesicle-mediated transport-related protein, putative  22.03 
 
 		 696 aa  51.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.567808  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32574  predicted protein  21.34 
 
 		 981 aa  46.6  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03830  clathrin binding protein, putative  19.65 
 
 		 732 aa  46.2  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>