29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL03830 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_03029  AP-1 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08970)  54.09 
 
 		 766 aa  770    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0965274 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03830  clathrin binding protein, putative  100 
 
 		 732 aa  1496    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03830  clathrin binding protein, putative  96.82 
 
 		 755 aa  1414    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74268  beta-adaptin, large subunit of the clathrin-associated protein (AP-1) complex  46.73 
 
 		 736 aa  593  1e-168  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04170  vesicle-mediated transport-related protein, putative  49.13 
 
 		 696 aa  553  1e-156  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.567808  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119607  Beta adaptin-like protein  48.5 
 
 		 551 aa  533  1e-150  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05950  AP-2 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10340)  44.22 
 
 		 717 aa  517  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84899  predicted protein  36.88 
 
 		 697 aa  374  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54730  predicted protein  30.38 
 
 		 805 aa  272  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.442884  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86921  predicted protein  29.46 
 
 		 785 aa  257  7e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44118  predicted protein  30.14 
 
 		 676 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.139737  normal  0.0310937 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00165  AP-3 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11360)  27.36 
 
 		 841 aa  179  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.318304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06410  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  25.17 
 
 		 835 aa  159  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_54789  predicted protein  24.18 
 
 		 1205 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88879  clathrin assembly complex beta adaptin component  24.28 
 
 		 817 aa  115  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.789212 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91200  predicted protein  21.65 
 
 		 947 aa  75.9  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49385  predicted protein  21.52 
 
 		 936 aa  72.4  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0497486  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02780  ER to Golgi transport-related protein, putative  19.58 
 
 		 952 aa  71.2  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.346474  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42302  predicted protein  22.18 
 
 		 622 aa  69.7  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110936  hitchhiker  0.00027641 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54511  predicted protein  21.4 
 
 		 978 aa  62.4  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04207  AP-1 adaptor complex subunit gamma, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06030)  20.53 
 
 		 839 aa  58.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10209  predicted protein  18.81 
 
 		 910 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01870  gamma-adaptin, putative  23.12 
 
 		 854 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.543816  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01177  Coatomer subunit beta, putative (Eurofung)  24.82 
 
 		 950 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74925  coatomer gamma non-clathrin coat protein involved in transport between ER and Golgi  20.3 
 
 		 935 aa  48.5  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0538338  normal  0.0907114 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44719  predicted protein  24.64 
 
 		 895 aa  47.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00567496  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08291  AP-3 complex subunit delta, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03640)  26.56 
 
 		 934 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.258771  hitchhiker  0.0000000134894 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04547  Coatomer subunit gamma, putative (Eurofung)  20.62 
 
 		 917 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152714  normal  0.168671 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54028  predicted protein  19.47 
 
 		 1277 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.214816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>