30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_119607 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009356  OSTLU_119607  Beta adaptin-like protein  100 
 
 		 551 aa  1132    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03830  clathrin binding protein, putative  47.94 
 
 		 755 aa  538  1e-151  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03830  clathrin binding protein, putative  48.5 
 
 		 732 aa  533  1e-150  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03029  AP-1 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08970)  46.79 
 
 		 766 aa  520  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0965274 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04170  vesicle-mediated transport-related protein, putative  45.62 
 
 		 696 aa  473  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.567808  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05950  AP-2 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10340)  41.85 
 
 		 717 aa  445  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74268  beta-adaptin, large subunit of the clathrin-associated protein (AP-1) complex  42.21 
 
 		 736 aa  427  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84899  predicted protein  33.83 
 
 		 697 aa  311  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54730  predicted protein  30.51 
 
 		 805 aa  256  9e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.442884  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86921  predicted protein  28.86 
 
 		 785 aa  230  5e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44118  predicted protein  27.75 
 
 		 676 aa  178  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.139737  normal  0.0310937 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06410  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  27.92 
 
 		 835 aa  168  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00165  AP-3 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11360)  26.69 
 
 		 841 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.318304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88879  clathrin assembly complex beta adaptin component  25.29 
 
 		 817 aa  124  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.789212 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_54789  predicted protein  26.93 
 
 		 1205 aa  111  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42302  predicted protein  22.43 
 
 		 622 aa  69.3  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110936  hitchhiker  0.00027641 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01177  Coatomer subunit beta, putative (Eurofung)  21.95 
 
 		 950 aa  68.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02780  ER to Golgi transport-related protein, putative  18 
 
 		 952 aa  67.8  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.346474  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44719  predicted protein  23.6 
 
 		 895 aa  54.7  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00567496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54511  predicted protein  26.32 
 
 		 978 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04207  AP-1 adaptor complex subunit gamma, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06030)  19.55 
 
 		 839 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00660  vesicle-mediated transport-related protein, putative  23.86 
 
 		 1063 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82880  predicted protein  22.1 
 
 		 812 aa  48.1  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04547  Coatomer subunit gamma, putative (Eurofung)  20.41 
 
 		 917 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152714  normal  0.168671 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  28 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49385  predicted protein  17.02 
 
 		 936 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0497486  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.46 
 
 		 1343 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119532  Coatomer gamma subunit  20.59 
 
 		 868 aa  43.9  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39338  predicted protein  20.7 
 
 		 630 aa  43.5  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109278  normal  0.0495163 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>