21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_49385 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_54511  predicted protein  43.74 
 
 
978 aa  731    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49385  predicted protein  100 
 
 
936 aa  1933    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0497486  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01177  Coatomer subunit beta, putative (Eurofung)  43.81 
 
 
950 aa  796    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91200  predicted protein  40.95 
 
 
947 aa  719    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02780  ER to Golgi transport-related protein, putative  43.73 
 
 
952 aa  786    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.346474  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24457  predicted protein  23.1 
 
 
829 aa  75.5  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0686631  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03830  clathrin binding protein, putative  21.52 
 
 
732 aa  72.4  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44719  predicted protein  23.66 
 
 
895 aa  68.6  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00567496  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03830  clathrin binding protein, putative  20.7 
 
 
755 aa  65.5  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54730  predicted protein  22.22 
 
 
805 aa  62  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.442884  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42302  predicted protein  23.22 
 
 
622 aa  58.2  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110936  hitchhiker  0.00027641 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82880  predicted protein  22.26 
 
 
812 aa  57.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04207  AP-1 adaptor complex subunit gamma, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06030)  22.48 
 
 
839 aa  54.3  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44118  predicted protein  21.94 
 
 
676 aa  52.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.139737  normal  0.0310937 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74268  beta-adaptin, large subunit of the clathrin-associated protein (AP-1) complex  22.88 
 
 
736 aa  50.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06410  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  24.68 
 
 
835 aa  50.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13511  predicted protein  20.9 
 
 
939 aa  48.5  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03029  AP-1 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08970)  18.12 
 
 
766 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0965274 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00165  AP-3 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11360)  20.43 
 
 
841 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.318304  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05950  AP-2 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10340)  21.97 
 
 
717 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119607  Beta adaptin-like protein  17.23 
 
 
551 aa  45.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>