22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC06410 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC06410  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  100 
 
 		 835 aa  1703    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00165  AP-3 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11360)  30.65 
 
 		 841 aa  319  1e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.318304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44118  predicted protein  32.2 
 
 		 676 aa  273  1e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.139737  normal  0.0310937 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88879  clathrin assembly complex beta adaptin component  29.34 
 
 		 817 aa  240  6.999999999999999e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.789212 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_54789  predicted protein  29.12 
 
 		 1205 aa  229  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03029  AP-1 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08970)  25.87 
 
 		 766 aa  174  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0965274 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119607  Beta adaptin-like protein  27.74 
 
 		 551 aa  169  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03830  clathrin binding protein, putative  25.37 
 
 		 732 aa  162  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03830  clathrin binding protein, putative  24.61 
 
 		 755 aa  159  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04170  vesicle-mediated transport-related protein, putative  23.67 
 
 		 696 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.567808  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74268  beta-adaptin, large subunit of the clathrin-associated protein (AP-1) complex  22.76 
 
 		 736 aa  127  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05950  AP-2 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10340)  22.77 
 
 		 717 aa  124  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86921  predicted protein  21.92 
 
 		 785 aa  105  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54730  predicted protein  20.78 
 
 		 805 aa  96.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.442884  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84899  predicted protein  21.29 
 
 		 697 aa  70.9  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01177  Coatomer subunit beta, putative (Eurofung)  25.93 
 
 		 950 aa  65.1  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02780  ER to Golgi transport-related protein, putative  24.41 
 
 		 952 aa  59.3  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.346474  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91200  predicted protein  22.95 
 
 		 947 aa  58.5  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54511  predicted protein  25.74 
 
 		 978 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49385  predicted protein  23.01 
 
 		 936 aa  50.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0497486  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39338  predicted protein  23.08 
 
 		 630 aa  45.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109278  normal  0.0495163 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42302  predicted protein  22.29 
 
 		 622 aa  44.3  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110936  hitchhiker  0.00027641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>