22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_91200 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_01177  Coatomer subunit beta, putative (Eurofung)  55.22 
 
 
950 aa  1069    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54511  predicted protein  38.48 
 
 
978 aa  654    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02780  ER to Golgi transport-related protein, putative  49.04 
 
 
952 aa  904    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.346474  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91200  predicted protein  100 
 
 
947 aa  1937    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49385  predicted protein  41.16 
 
 
936 aa  709    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0497486  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03830  clathrin binding protein, putative  21.65 
 
 
732 aa  75.5  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03830  clathrin binding protein, putative  21.33 
 
 
755 aa  73.2  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04207  AP-1 adaptor complex subunit gamma, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06030)  22.38 
 
 
839 aa  69.3  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82880  predicted protein  24.38 
 
 
812 aa  68.2  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39338  predicted protein  21.19 
 
 
630 aa  66.6  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109278  normal  0.0495163 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_54789  predicted protein  31.97 
 
 
1205 aa  64.3  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01870  gamma-adaptin, putative  23.31 
 
 
854 aa  62.8  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.543816  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44118  predicted protein  23.13 
 
 
676 aa  62.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.139737  normal  0.0310937 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24457  predicted protein  22.74 
 
 
829 aa  61.6  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0686631  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04170  vesicle-mediated transport-related protein, putative  19.83 
 
 
696 aa  61.6  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.567808  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44719  predicted protein  23.97 
 
 
895 aa  60.1  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00567496  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06410  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  23.03 
 
 
835 aa  55.5  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54730  predicted protein  21.98 
 
 
805 aa  54.7  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.442884  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03029  AP-1 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08970)  20.98 
 
 
766 aa  52  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0965274 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16891  predicted protein  21.48 
 
 
450 aa  50.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05950  AP-2 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10340)  21.84 
 
 
717 aa  49.7  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42302  predicted protein  19.19 
 
 
622 aa  48.1  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110936  hitchhiker  0.00027641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>