21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16891 on replicon NC_011697
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011697  PHATRDRAFT_16891  predicted protein  100 
 
 
450 aa  935    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39338  predicted protein  43.85 
 
 
630 aa  384  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109278  normal  0.0495163 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01870  gamma-adaptin, putative  29.93 
 
 
854 aa  202  7e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.543816  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24457  predicted protein  27.73 
 
 
829 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0686631  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04207  AP-1 adaptor complex subunit gamma, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06030)  26.95 
 
 
839 aa  177  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82880  predicted protein  24.66 
 
 
812 aa  169  7e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13511  predicted protein  26.88 
 
 
939 aa  160  5e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_278  predicted protein  25.45 
 
 
971 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.385886 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48152  predicted protein  25 
 
 
979 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0169632 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07016  AP-2 adaptor complex subunit alpha, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04310)  25.65 
 
 
935 aa  153  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00660  vesicle-mediated transport-related protein, putative  23.41 
 
 
1063 aa  151  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54442  predicted protein  25.31 
 
 
1019 aa  146  8.000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.595032  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44719  predicted protein  23.37 
 
 
895 aa  124  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00567496  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54028  predicted protein  23.91 
 
 
1277 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.214816  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32574  predicted protein  22.7 
 
 
981 aa  114  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08291  AP-3 complex subunit delta, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03640)  25.55 
 
 
934 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.258771  hitchhiker  0.0000000134894 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42302  predicted protein  21.3 
 
 
622 aa  109  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110936  hitchhiker  0.00027641 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04870  conserved hypothetical protein  32.09 
 
 
857 aa  68.2  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00910  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  27.52 
 
 
932 aa  57.8  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.752282  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91200  predicted protein  21.48 
 
 
947 aa  50.4  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74268  beta-adaptin, large subunit of the clathrin-associated protein (AP-1) complex  18.43 
 
 
736 aa  48.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>