24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG00660 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07016  AP-2 adaptor complex subunit alpha, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04310)  55.07 
 
 
935 aa  716    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00660  vesicle-mediated transport-related protein, putative  100 
 
 
1063 aa  2198    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54442  predicted protein  38.2 
 
 
1019 aa  432  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.595032  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48152  predicted protein  35.59 
 
 
979 aa  416  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0169632 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_278  predicted protein  35.59 
 
 
971 aa  416  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.385886 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32574  predicted protein  33.83 
 
 
981 aa  367  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04207  AP-1 adaptor complex subunit gamma, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06030)  26.66 
 
 
839 aa  248  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01870  gamma-adaptin, putative  28.71 
 
 
854 aa  245  3e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.543816  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24457  predicted protein  26.41 
 
 
829 aa  209  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0686631  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82880  predicted protein  26.32 
 
 
812 aa  205  4e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13511  predicted protein  24.7 
 
 
939 aa  201  5e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39338  predicted protein  24.85 
 
 
630 aa  184  7e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109278  normal  0.0495163 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16891  predicted protein  23.41 
 
 
450 aa  151  7e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54028  predicted protein  21.38 
 
 
1277 aa  107  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.214816  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42302  predicted protein  19.57 
 
 
622 aa  93.2  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110936  hitchhiker  0.00027641 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44719  predicted protein  21.42 
 
 
895 aa  91.7  7e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00567496  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08291  AP-3 complex subunit delta, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03640)  21.88 
 
 
934 aa  67.4  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.258771  hitchhiker  0.0000000134894 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03029  AP-1 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08970)  24.38 
 
 
766 aa  60.1  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0965274 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54730  predicted protein  24.7 
 
 
805 aa  58.5  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.442884  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05950  AP-2 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10340)  21.12 
 
 
717 aa  52  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119607  Beta adaptin-like protein  23.86 
 
 
551 aa  49.3  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00165  AP-3 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11360)  25.41 
 
 
841 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.318304  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03830  clathrin binding protein, putative  20 
 
 
755 aa  45.4  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74268  beta-adaptin, large subunit of the clathrin-associated protein (AP-1) complex  19.22 
 
 
736 aa  45.1  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>