24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40672 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  100 
 
 		 1034 aa  1828    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37425  predicted protein  39.64 
 
 		 1569 aa  278  3e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.61446  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13439  predicted protein  42.82 
 
 		 347 aa  181  7e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199719  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11472  predicted protein  46.78 
 
 		 344 aa  170  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.408612  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2382  TRD5  44.98 
 
 		 253 aa  149  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44134  predicted protein  37.96 
 
 		 245 aa  124  8e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15060  predicted protein  43.94 
 
 		 191 aa  122  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48553  predicted protein  37.38 
 
 		 952 aa  88.6  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.102709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7107  hypothetical protein  29.33 
 
 		 829 aa  81.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34245  predicted protein  46.94 
 
 		 164 aa  67.8  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0191281  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  45.54 
 
 		 3670 aa  64.3  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38100  predicted protein  48.75 
 
 		 133 aa  60.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  21.35 
 
 		 495 aa  55.5  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  27.01 
 
 		 429 aa  55.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  28.15 
 
 		 421 aa  54.3  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  30.48 
 
 		 940 aa  52.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0786  penicillin-binding protein 1C  49.33 
 
 		 1060 aa  50.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.879691  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0680  penicillin-binding protein  48.05 
 
 		 942 aa  49.3  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  36.75 
 
 		 325 aa  48.9  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3947  hypothetical protein  23.04 
 
 		 285 aa  47.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.964511  normal  0.031709 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0970  hypothetical protein  24.88 
 
 		 983 aa  46.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351823  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4454  hypothetical protein  53.06 
 
 		 917 aa  45.8  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50095  predicted protein  39.53 
 
 		 982 aa  45.8  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  32.18 
 
 		 334 aa  45.1  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>