163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38534 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_38534  predicted protein  100 
 
 
204 aa  419  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.087492  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  44.16 
 
 
168 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  43.51 
 
 
157 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0283  Redoxin domain protein  44.16 
 
 
168 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00098707  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  42.34 
 
 
251 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  45.19 
 
 
159 aa  105  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0288  redoxin domain-containing protein  43.51 
 
 
185 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000039073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0401  redoxin domain-containing protein  41.72 
 
 
192 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.48 
 
 
168 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  43.88 
 
 
168 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4903  Redoxin domain protein  41.18 
 
 
168 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6651  Redoxin domain protein  39.19 
 
 
189 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  39.42 
 
 
245 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1274  redoxin domain-containing protein  43.66 
 
 
168 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125392  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  37.96 
 
 
249 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0751  redoxin  37.01 
 
 
161 aa  99.4  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.28 
 
 
157 aa  99  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0483  thiol peroxidase  43.22 
 
 
161 aa  98.6  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3785  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.94 
 
 
183 aa  98.6  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.144432  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6935  Redoxin domain protein  44.85 
 
 
160 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  38.46 
 
 
248 aa  98.6  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3433  AhpC/TSA-family protein  39.33 
 
 
169 aa  98.6  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313282  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  37.93 
 
 
242 aa  98.2  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  39.42 
 
 
242 aa  98.2  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  38.46 
 
 
248 aa  98.2  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_004310  BR0478  ahpC/TSA family protein  43.22 
 
 
161 aa  98.2  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.210689  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  38.36 
 
 
248 aa  98.2  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.37 
 
 
167 aa  97.8  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  38.89 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  42.02 
 
 
162 aa  97.1  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6266  redoxin domain-containing protein  44.12 
 
 
160 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2596  redoxin domain-containing protein  45.83 
 
 
161 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.97 
 
 
159 aa  96.7  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  38.69 
 
 
243 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  38.69 
 
 
243 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0469  redoxin domain-containing protein  37.5 
 
 
168 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0173332  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  38.69 
 
 
242 aa  97.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  42.34 
 
 
243 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0494  redoxin domain-containing protein  37.5 
 
 
168 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570161  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  42.24 
 
 
160 aa  96.3  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0439  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  35.29 
 
 
162 aa  95.9  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3915  redoxin domain-containing protein  40.77 
 
 
159 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.145792 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1067  peroxiredoxin  44.44 
 
 
161 aa  95.9  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0619  Redoxin domain protein  44.92 
 
 
161 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  40.15 
 
 
243 aa  95.5  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  39.1 
 
 
162 aa  95.5  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  38.57 
 
 
243 aa  95.1  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3538  AhpC/TSA family protein  37.66 
 
 
214 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1324  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant  34.19 
 
 
190 aa  95.1  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3651  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.5 
 
 
168 aa  95.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000135148  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1124  AhpC/TSA family protein  37.18 
 
 
185 aa  95.1  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  38.35 
 
 
247 aa  94.7  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3519  anti-oxidant AhpCTSA family protein  37.18 
 
 
168 aa  94.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3544  anti-oxidant AhpCTSA family protein  37.18 
 
 
168 aa  94.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  40.88 
 
 
243 aa  94.7  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  40.88 
 
 
243 aa  94.7  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1324  AhpC/TSA family protein  36.63 
 
 
190 aa  94.7  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  37.5 
 
 
247 aa  94.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  37.5 
 
 
247 aa  94.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3239  AhpC/TSA family protein  36.21 
 
 
185 aa  94.7  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0661  Redoxin domain protein  45.76 
 
 
161 aa  94.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.165122 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  40.88 
 
 
243 aa  94.7  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2544  AhpC/TSA family protein  36.63 
 
 
214 aa  94.4  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  35.29 
 
 
169 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0465  AhpC/TSA family protein  36.63 
 
 
214 aa  94.4  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490707  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2830  redoxin domain-containing protein  37.5 
 
 
168 aa  94.4  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000266084  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3890  peroxiredoxin  34.84 
 
 
174 aa  94.7  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0083  redoxin  36.84 
 
 
168 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000103454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0565  redoxin domain-containing protein  36.84 
 
 
168 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0157246  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  37.16 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2623  Redoxin domain protein  39.69 
 
 
160 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  38.97 
 
 
245 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0536  redoxin domain-containing protein  36.84 
 
 
168 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397441  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0141  anti-oxidant AhpCTSA family protein  40.87 
 
 
157 aa  92.8  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1257  Redoxin domain protein  43.86 
 
 
161 aa  92.8  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  41.6 
 
 
157 aa  92.8  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  43.31 
 
 
168 aa  92.4  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0966  putative antioxidant  36.6 
 
 
157 aa  92.4  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.272131  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2838  type 2 peroxiredoxin protein  37.59 
 
 
166 aa  92  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.15733  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2973  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.92 
 
 
168 aa  92  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00621825  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3083  Redoxin domain protein  38.69 
 
 
166 aa  92  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0388194  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  36.5 
 
 
259 aa  92  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2718  Redoxin domain protein  38.69 
 
 
166 aa  92  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  38.69 
 
 
247 aa  92  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  37.23 
 
 
243 aa  92  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.75 
 
 
158 aa  91.7  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000593  antioxidant putative  40.3 
 
 
157 aa  91.7  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000019477  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2818  Redoxin domain protein  38.93 
 
 
160 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  39.85 
 
 
160 aa  91.3  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2595  redoxin domain-containing protein  38.93 
 
 
160 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4889  thioredoxin reductase  38.69 
 
 
243 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.0936024 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2472  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  37.5 
 
 
161 aa  90.9  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.935379  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  40.8 
 
 
157 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  40.8 
 
 
157 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  40.8 
 
 
157 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2855  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  35.9 
 
 
157 aa  90.5  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  40.68 
 
 
160 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3641  redoxin domain-containing protein  43.36 
 
 
178 aa  90.9  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.731441  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3947  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
159 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3040  redoxin domain-containing protein  35.42 
 
 
176 aa  90.1  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.825504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>