23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_24886 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_24886  predicted protein  100 
 
 
200 aa  399  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25566  predicted protein  33.93 
 
 
338 aa  85.1  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02885  Non-histone chromosomal protein 6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B995]  50 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00549573  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6025  predicted protein  34.87 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_23779  Nonhistone chromosomal protein 6A  45.24 
 
 
85 aa  73.2  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.667446  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04730  nonhistone protein 6, putative  47.95 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0853417  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18991  predicted protein  43.04 
 
 
622 aa  68.2  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0475639  normal  0.137229 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11286  predicted protein  42.47 
 
 
75 aa  65.9  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673219  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12674  predicted protein  36.36 
 
 
90 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16581  predicted protein  34 
 
 
133 aa  61.6  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28032  predicted protein  35.37 
 
 
273 aa  58.5  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0307251  normal  0.690356 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37272  predicted protein  31.93 
 
 
351 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04220  nonhistone protein 6, putative  35.62 
 
 
240 aa  52.4  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.219393  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32993  predicted protein  26.83 
 
 
306 aa  51.6  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161398  normal  0.121587 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66957  high mobility group-like protein  29.41 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49362  predicted protein  27.06 
 
 
363 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_31946  predicted protein  34.72 
 
 
95 aa  48.5  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04270  HMG1, putative  27.91 
 
 
895 aa  47.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10103  HMG box protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04550)  33.73 
 
 
297 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.178896 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8737  predicted protein  31.94 
 
 
89 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_12709  non-histone protein 10  28.75 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0597181  normal  0.318516 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45968  predicted protein  34.85 
 
 
304 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42576  predicted protein  25 
 
 
461 aa  42.4  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.536498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>