58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0848 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0848  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  672    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1960  hypothetical protein  28.92 
 
 
327 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.220534 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5493  hypothetical protein  27.02 
 
 
326 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595144  normal  0.225489 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4654  Domain of unknown function DUF1814  28.38 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.929553  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0200  hypothetical protein  25.41 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2544  hypothetical protein  25.76 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2452  hypothetical protein  25.86 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.48779  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1569  hypothetical protein  28.45 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110325  normal  0.0638438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3050  hypothetical protein  27.27 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.818716 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0213  hypothetical protein  25.08 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.703328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4355  hypothetical protein  24.9 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678013  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  26.48 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5265  hypothetical protein  26.69 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00288645  unclonable  0.000020149 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4457  hypothetical protein  24.26 
 
 
313 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06811  hypothetical protein  28.32 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1328  hypothetical protein  39.36 
 
 
348 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261253  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4161  hypothetical protein  23.93 
 
 
313 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.162977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7702  hypothetical protein  25.96 
 
 
347 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119439 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0218  hypothetical protein  29.74 
 
 
331 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf137  hypothetical protein  27.03 
 
 
346 aa  63.2  0.000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0341957  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3046  hypothetical protein  36.96 
 
 
338 aa  63.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137225  normal  0.0781322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3057  protein of unknown function DUF1814  36.96 
 
 
338 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2490  hypothetical protein  27.56 
 
 
346 aa  62.8  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0394  hypothetical protein  26.32 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1625  hypothetical protein  24.57 
 
 
339 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0784  hypothetical protein  37.35 
 
 
368 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2334  hypothetical protein  40.54 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.937968  normal  0.0991632 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0294  hypothetical protein  26.22 
 
 
329 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0754  hypothetical protein  26.89 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1225  hypothetical protein  35.87 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3510  hypothetical protein  35.87 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0233034  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2408  hypothetical protein  28.24 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0434  hypothetical protein  32.41 
 
 
339 aa  60.1  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1847  hypothetical protein  23.56 
 
 
361 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.283474 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1420  Domain of unknown function DUF1814  24.64 
 
 
338 aa  57.4  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0890  hypothetical protein  44.44 
 
 
337 aa  57  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000838663  hitchhiker  0.00000000010514 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4292  hypothetical protein  41.18 
 
 
344 aa  56.6  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2690  hypothetical protein  37.18 
 
 
187 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0052  hypothetical protein  32.32 
 
 
355 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.962002  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5328  hypothetical protein  42.47 
 
 
83 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1821  hypothetical protein  43.55 
 
 
327 aa  53.9  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4391  hypothetical protein  40 
 
 
78 aa  53.5  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3786  hypothetical protein  45.07 
 
 
335 aa  52.8  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4997  hypothetical protein  39.29 
 
 
247 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2171  hypothetical protein  37.08 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690317  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2937  hypothetical protein  26.46 
 
 
269 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283866  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3417  hypothetical protein  25.11 
 
 
315 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0717  hypothetical protein  55.1 
 
 
299 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0716673  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0281  hypothetical protein  44.9 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3302  hypothetical protein  25.71 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52051  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0191  Domain of unknown function DUF1814  34.43 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233104  hitchhiker  0.00266112 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4908  Domain of unknown function DUF1814  41.67 
 
 
267 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  34.25 
 
 
399 aa  46.6  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3801  hypothetical protein  30.86 
 
 
259 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0441026  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1879  hypothetical protein  41.51 
 
 
246 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.671388  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1969  hypothetical protein  51.02 
 
 
296 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0846  hypothetical protein  27.19 
 
 
328 aa  43.5  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.22305  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3270  hypothetical protein  22.97 
 
 
303 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>