219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0804 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0804  flavodoxin  100 
 
 		 402 aa  840    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  47.75 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  46.31 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  44.36 
 
 		 398 aa  377  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  43.72 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  43.56 
 
 		 414 aa  310  2e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  40.77 
 
 		 402 aa  308  9e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  38.06 
 
 		 401 aa  295  1e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2027  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.9 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.719198  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0504  beta-lactamase domain protein  35.31 
 
 		 405 aa  253  6e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06350  uncharacterized flavoprotein  38.14 
 
 		 420 aa  238  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.882044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  32.15 
 
 		 396 aa  219  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2284  uncharacterized flavoprotein  32.61 
 
 		 411 aa  215  9e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014767  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  32.6 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  31.06 
 
 		 401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  31.84 
 
 		 395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  32.16 
 
 		 397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  32.91 
 
 		 396 aa  213  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.26 
 
 		 479 aa  212  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.26 
 
 		 479 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  34.26 
 
 		 479 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.26 
 
 		 479 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.26 
 
 		 479 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  35.07 
 
 		 479 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1078  metallo-beta-lactamase family protein  32.03 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  33.42 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.07 
 
 		 479 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.01 
 
 		 479 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  31.14 
 
 		 392 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.42 
 
 		 479 aa  210  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  32.15 
 
 		 397 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  34.5 
 
 		 402 aa  207  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.07 
 
 		 479 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  33.72 
 
 		 401 aa  206  6e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  32.34 
 
 		 393 aa  205  9e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.79 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.79 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.79 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.88 
 
 		 504 aa  203  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.79 
 
 		 500 aa  202  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.52 
 
 		 482 aa  202  8e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.13 
 
 		 397 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.67 
 
 		 505 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.52 
 
 		 479 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  31.04 
 
 		 387 aa  199  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  32.82 
 
 		 384 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2889  beta-lactamase domain-containing protein  32.23 
 
 		 410 aa  199  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.726482  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.51 
 
 		 494 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.33 
 
 		 485 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.79 
 
 		 498 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 		 396 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.88 
 
 		 493 aa  196  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.51 
 
 		 499 aa  195  9e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  31.41 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  29.62 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 400 aa  193  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.67 
 
 		 503 aa  193  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  29.68 
 
 		 399 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  29.68 
 
 		 399 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  28.75 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  32.23 
 
 		 884 aa  192  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  29.34 
 
 		 878 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  29.47 
 
 		 404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  29.1 
 
 		 878 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  31.2 
 
 		 508 aa  189  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  30.08 
 
 		 404 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1485  beta-lactamase-like protein  31.31 
 
 		 417 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000931355  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  30.2 
 
 		 397 aa  187  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  28.29 
 
 		 405 aa  186  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  31.73 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  30.27 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.27 
 
 		 396 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  29.87 
 
 		 395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  28.82 
 
 		 404 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  29.47 
 
 		 392 aa  179  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  29.78 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  29.37 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.14 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  30.13 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  30.48 
 
 		 404 aa  176  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  29.5 
 
 		 397 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 		 387 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  29.35 
 
 		 425 aa  176  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1933  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 		 396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.837392  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 		 407 aa  173  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0432  beta-lactamase domain-containing protein  28.47 
 
 		 404 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253728  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  30.12 
 
 		 400 aa  172  7.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0614  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  29.21 
 
 		 407 aa  170  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  30.79 
 
 		 387 aa  170  5e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1920  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 		 393 aa  170  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  28.89 
 
 		 407 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  27.79 
 
 		 407 aa  167  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 		 392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2086  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 		 394 aa  166  9e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  29.82 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0386  beta-lactamase domain-containing protein  29.24 
 
 		 407 aa  163  6e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.458991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>