40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0438 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  99.83 
 
 
592 aa  1188    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  100 
 
 
592 aa  1191    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  51.69 
 
 
569 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  48.97 
 
 
557 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  36.03 
 
 
605 aa  348  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4315  hypothetical protein  28.03 
 
 
558 aa  204  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248191  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  33.73 
 
 
533 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  29.58 
 
 
526 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  33.73 
 
 
533 aa  83.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  31.79 
 
 
517 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  29.92 
 
 
547 aa  82  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  30.51 
 
 
546 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  32.57 
 
 
532 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  27.78 
 
 
546 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  27.78 
 
 
546 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 
513 aa  74.3  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  29.06 
 
 
528 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  29.06 
 
 
528 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  33.97 
 
 
492 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  29.15 
 
 
563 aa  64.7  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2984  hypothetical protein  28.81 
 
 
543 aa  65.1  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000954014  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  28.92 
 
 
564 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  28.92 
 
 
536 aa  58.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  29.03 
 
 
535 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  28.48 
 
 
557 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  28.48 
 
 
557 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  27.82 
 
 
618 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 
510 aa  48.5  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  30.83 
 
 
588 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  31.89 
 
 
558 aa  48.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  26.2 
 
 
658 aa  47.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  26.19 
 
 
531 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  34.55 
 
 
531 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  24.26 
 
 
618 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  39.53 
 
 
516 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  27.39 
 
 
727 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  38.37 
 
 
516 aa  43.9  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  38.37 
 
 
516 aa  43.9  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  38.37 
 
 
516 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  38.37 
 
 
516 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>