More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0418 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  72.12 
 
 
420 aa  660  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  2.91669e-06 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  70.17 
 
 
420 aa  642  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  70.55 
 
 
423 aa  642  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  100 
 
 
419 aa  867  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  99.52 
 
 
419 aa  865  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  72.77 
 
 
420 aa  648  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  80.43 
 
 
420 aa  719  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  66.83 
 
 
419 aa  598  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  58.68 
 
 
417 aa  515  1e-145  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  56.86 
 
 
426 aa  508  1e-142  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  55.88 
 
 
434 aa  501  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  57.35 
 
 
428 aa  500  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  57.21 
 
 
416 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  56.72 
 
 
416 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  53.94 
 
 
417 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  54.09 
 
 
419 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.43 
 
 
417 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.57 
 
 
406 aa  475  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  53.73 
 
 
425 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  54.43 
 
 
417 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.23 
 
 
406 aa  468  1e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.48 
 
 
412 aa  463  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  52.72 
 
 
419 aa  464  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  52.96 
 
 
414 aa  458  1e-128  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.74 
 
 
406 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.6 
 
 
414 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.63 
 
 
404 aa  455  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  52.49 
 
 
406 aa  452  1e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  52.74 
 
 
406 aa  453  1e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.74 
 
 
406 aa  454  1e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  52.49 
 
 
406 aa  452  1e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  52.74 
 
 
406 aa  453  1e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  52.74 
 
 
406 aa  452  1e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  52.49 
 
 
406 aa  452  1e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  52.74 
 
 
406 aa  452  1e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  52.74 
 
 
406 aa  453  1e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.1 
 
 
414 aa  452  1e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.99 
 
 
412 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  52.35 
 
 
420 aa  451  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  52.24 
 
 
406 aa  448  1e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.49 
 
 
404 aa  446  1e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  50.74 
 
 
408 aa  442  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  52.18 
 
 
496 aa  443  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  51.47 
 
 
410 aa  438  1e-122  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.5 
 
 
409 aa  440  1e-122  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.23 
 
 
404 aa  441  1e-122  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.73 
 
 
451 aa  438  1e-122  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  50.25 
 
 
408 aa  435  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.62 
 
 
420 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  51.89 
 
 
412 aa  432  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  51.46 
 
 
410 aa  434  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  50.86 
 
 
415 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.99 
 
 
414 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.24 
 
 
413 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.88 
 
 
414 aa  434  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.88 
 
 
411 aa  432  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  51.84 
 
 
417 aa  433  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.88 
 
 
412 aa  432  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.37 
 
 
412 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  3.85676e-08  unclonable  1.52095e-15 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.63 
 
 
444 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  52.48 
 
 
405 aa  429  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.25 
 
 
415 aa  431  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.26 
 
 
414 aa  431  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  49.76 
 
 
414 aa  431  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.4 
 
 
414 aa  427  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.37 
 
 
415 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  49.26 
 
 
405 aa  427  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  49.26 
 
 
405 aa  426  1e-118  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.37 
 
 
410 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.74 
 
 
408 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.25 
 
 
415 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.76 
 
 
673 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.86 
 
 
428 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.5 
 
 
417 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.37 
 
 
415 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.43 
 
 
418 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  49.25 
 
 
414 aa  424  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  48.27 
 
 
413 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.04 
 
 
415 aa  424  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  47.95 
 
 
429 aa  423  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  50.99 
 
 
414 aa  422  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  48.5 
 
 
413 aa  423  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.5 
 
 
413 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  48.01 
 
 
404 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.13 
 
 
414 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.5 
 
 
413 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  48.51 
 
 
420 aa  421  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.76 
 
 
674 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.63 
 
 
418 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.13 
 
 
774 aa  421  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  48.87 
 
 
626 aa  419  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.15 
 
 
413 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.76 
 
 
672 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.5 
 
 
664 aa  416  1e-115  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  7.69952e-06 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.64 
 
 
414 aa  417  1e-115  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.11 
 
 
608 aa  417  1e-115  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  48.79 
 
 
421 aa  417  1e-115  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  49.26 
 
 
416 aa  417  1e-115  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  49 
 
 
419 aa  418  1e-115  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.15 
 
 
429 aa  417  1e-115  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>