50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2861 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2861  protein of unknown function DUF114  100 
 
 
336 aa  698    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0878  hypothetical protein  56.97 
 
 
338 aa  403  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1629  R2.LlaJI  53.47 
 
 
349 aa  373  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0248162  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1836  hypothetical protein  53.03 
 
 
354 aa  371  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3346  protein of unknown function DUF114  29.77 
 
 
258 aa  92.8  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3172  protein of unknown function DUF114  30.42 
 
 
328 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.601853  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0940  hypothetical protein  26.72 
 
 
330 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3727  hypothetical protein  27.21 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175021  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3424  protein of unknown function DUF114  28.12 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  28.68 
 
 
280 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3471  protein of unknown function DUF114  25.3 
 
 
296 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03440  periplasmic serine protease (ClpP class)  26.7 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0011  hypothetical protein  28.88 
 
 
284 aa  63.9  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  26.15 
 
 
286 aa  62.8  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0011  hypothetical protein  27.47 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0558  protein of unknown function DUF114  26.47 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3527  protein of unknown function DUF114  25 
 
 
275 aa  59.7  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  26.16 
 
 
279 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4681  hypothetical protein  24.04 
 
 
338 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214959  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  27.44 
 
 
274 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7800  hypothetical protein  28.82 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  25.93 
 
 
292 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  26.98 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  24.88 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2943  hypothetical protein  23.53 
 
 
279 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3097  hypothetical protein  23.08 
 
 
282 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2712  protein of unknown function DUF114  25.1 
 
 
269 aa  52.8  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  24.69 
 
 
280 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3319  hypothetical protein  23.69 
 
 
278 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  26.63 
 
 
274 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3600  hypothetical protein  26.83 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.354038  normal  0.0141904 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1401  protein of unknown function DUF114  24.51 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129163  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  23.27 
 
 
283 aa  50.1  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  23.71 
 
 
276 aa  50.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  27 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4091  hypothetical protein  23.73 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  27.27 
 
 
247 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1874  hypothetical protein  25 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923248  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  24.22 
 
 
272 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4766  protein of unknown function DUF114  23.94 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0583634  hitchhiker  0.000468876 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1781  hypothetical protein  24.18 
 
 
276 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  21.65 
 
 
279 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11070  periplasmic serine protease (ClpP class)  29.27 
 
 
265 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000898783  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0335  hypothetical protein  25 
 
 
281 aa  43.9  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0491521  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2112  hypothetical protein  26.97 
 
 
350 aa  43.5  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492379  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1299  protein of unknown function DUF114  21.74 
 
 
277 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  37.14 
 
 
620 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  27.19 
 
 
247 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  27.19 
 
 
248 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  32.86 
 
 
229 aa  42.4  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>