More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2612 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
353 aa  699    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.19 
 
 
349 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  hitchhiker  0.0000268959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.19 
 
 
349 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2322  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  68.56 
 
 
348 aa  488  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2469  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  69.71 
 
 
345 aa  484  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.12 
 
 
358 aa  487  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0891876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.47 
 
 
351 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  70 
 
 
424 aa  347  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.54 
 
 
328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000323084  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.31 
 
 
321 aa  288  9e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0231928  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.25 
 
 
321 aa  287  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.25 
 
 
321 aa  287  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.19 
 
 
321 aa  281  2e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000859188  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.19 
 
 
326 aa  270  4e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00111488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.69 
 
 
333 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.06 
 
 
325 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  42.81 
 
 
326 aa  258  8e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  44.86 
 
 
321 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  44.24 
 
 
321 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  44.06 
 
 
324 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
322 aa  249  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.161485  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.5 
 
 
326 aa  248  8e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.81 
 
 
344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.5 
 
 
318 aa  243  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
321 aa  242  7e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  41.25 
 
 
318 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  41.25 
 
 
318 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.25 
 
 
318 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.56 
 
 
318 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.57 
 
 
343 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.56 
 
 
324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.56 
 
 
326 aa  239  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
321 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.94 
 
 
318 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
311 aa  238  8e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000194917  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2593  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.76 
 
 
343 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  40.31 
 
 
318 aa  237  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.68 
 
 
332 aa  237  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00733957  hitchhiker  0.00049009 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.94 
 
 
318 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.57 
 
 
339 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0777268  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
338 aa  235  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  41.12 
 
 
321 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  40.62 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  41.1 
 
 
307 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.1 
 
 
307 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.75 
 
 
307 aa  232  9e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.61 
 
 
332 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
325 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
331 aa  229  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
321 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 
322 aa  227  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 
327 aa  226  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
328 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00290712 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.23 
 
 
328 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687314  normal  0.260687 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.86 
 
 
339 aa  224  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.186938  normal  0.127201 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
321 aa  224  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
321 aa  223  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 
328 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.111848  normal  0.36544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
306 aa  222  8e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1343  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.545551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14290  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.12 
 
 
329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 
327 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 
319 aa  219  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.77 
 
 
323 aa  219  7.999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
328 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2949  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  38.94 
 
 
316 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 
322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205475 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
330 aa  216  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.63 
 
 
316 aa  215  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.63 
 
 
316 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  38.63 
 
 
316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
319 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111157 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.32 
 
 
316 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
329 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.34 
 
 
328 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  normal  0.0366433 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  38.01 
 
 
316 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5516  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  36.09 
 
 
328 aa  210  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.472347  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  38.01 
 
 
316 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
327 aa  209  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.772391  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.8 
 
 
325 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26218  normal  0.0546823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
321 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181911  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.13 
 
 
326 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
315 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 
328 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00209232  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
326 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109225  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
327 aa  205  9e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000370081  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5699  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  35.38 
 
 
327 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0252968  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
319 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.5 
 
 
319 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540957  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.28 
 
 
314 aa  204  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
306 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  35 
 
 
306 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
327 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
306 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 
319 aa  202  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1683  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000273599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>