42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0091 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0091  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 
838 aa  1707  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195511 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5363  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.78 
 
 
812 aa  754  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.395815  normal  0.0592495 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1870  hypothetical protein  22.44 
 
 
691 aa  72.4  3e-11  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.65 
 
 
565 aa  58.9  3e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5141  hypothetical protein  20.25 
 
 
685 aa  53.9  1e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31971e-18 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  31.19 
 
 
1367 aa  53.5  2e-05  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  31.19 
 
 
1367 aa  53.5  2e-05  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.85 
 
 
952 aa  52.4  4e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  23.97 
 
 
457 aa  52  5e-05  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.95 
 
 
456 aa  51.2  8e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.16 
 
 
453 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3956  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.18 
 
 
502 aa  50.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0878  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.31 
 
 
375 aa  50.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628504  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  30.77 
 
 
530 aa  50.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  5.0364e-06  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0866  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.31 
 
 
375 aa  50.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000243712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0152  hypothetical protein  27.15 
 
 
664 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.038472 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0076  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.61 
 
 
442 aa  50.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.07 
 
 
205 aa  48.9  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  21.01 
 
 
180 aa  48.9  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.79 
 
 
453 aa  48.9  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0677  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.47 
 
 
392 aa  47.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3411  DNA-directed DNA polymerase  24.09 
 
 
215 aa  47.8  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.537666  normal  0.0817359 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  25.42 
 
 
1635 aa  47.8  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4078  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.36 
 
 
197 aa  47.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1688  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.7 
 
 
186 aa  47  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.609877 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  25.43 
 
 
1444 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3077  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.67 
 
 
383 aa  46.6  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  26.74 
 
 
1433 aa  45.8  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3616  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.97 
 
 
530 aa  45.8  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00210343  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0010  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  21.93 
 
 
289 aa  45.8  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847041  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.08 
 
 
459 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0914  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.97 
 
 
395 aa  45.8  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  25.71 
 
 
1407 aa  45.1  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0595  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.87 
 
 
170 aa  44.7  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.837923  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3006  exonuclease DNA polymerase III subunit epsilon  26.97 
 
 
381 aa  44.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00547496  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3040  DNA polymerase/helicase  26.97 
 
 
381 aa  44.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  4.76773e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1655  DNA polymerase III subunit epsilon  31.4 
 
 
302 aa  44.3  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2940  exonuclease DNA polymerase III subunit epsilon  26.97 
 
 
381 aa  44.3  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  1.47558e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.3 
 
 
449 aa  44.3  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1647  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.89 
 
 
466 aa  44.3  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3055  DNA polymerase III, epsilon subunit  25 
 
 
218 aa  44.3  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.15012e-05  normal  0.403566 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1394  DNA polymerase III subunit epsilon  30.95 
 
 
302 aa  44.3  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00500752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>