More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0058 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
275 aa  544  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.11 
 
 
294 aa  313  1e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1078  ABC transporter, nitrate-like  59.41 
 
 
275 aa  288  5e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193306  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.67 
 
 
259 aa  205  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.54 
 
 
276 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.1 
 
 
283 aa  181  9e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0466  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.23 
 
 
262 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4887  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.57 
 
 
296 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0123695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4930  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.09 
 
 
267 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
296 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.159688 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.18 
 
 
259 aa  169  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 
275 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.142025  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
257 aa  158  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369486  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
267 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
257 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.95 
 
 
291 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582448  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
289 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0761961  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2719  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.8 
 
 
284 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  37.39 
 
 
274 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  34.51 
 
 
279 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.55 
 
 
257 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214609  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  35.84 
 
 
274 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 
274 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
282 aa  141  1e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12004  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
292 aa  140  2e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 
255 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  37.18 
 
 
330 aa  136  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
412 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
283 aa  135  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
282 aa  134  1e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.285231  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
279 aa  134  2e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  32.91 
 
 
284 aa  132  4e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  32.91 
 
 
284 aa  132  4e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  32.91 
 
 
284 aa  132  4e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
267 aa  132  7e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
256 aa  131  1e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  36.32 
 
 
250 aa  131  1e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
280 aa  130  2e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
353 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.19574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.17 
 
 
256 aa  129  4e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7502  ABC transporter permease  32.9 
 
 
256 aa  129  5e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
353 aa  129  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
323 aa  128  1e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226274  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.68 
 
 
271 aa  128  1e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
357 aa  128  1e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0334046  normal  0.137928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
306 aa  127  2e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2477  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
289 aa  127  2e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1386  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  31.28 
 
 
323 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.101646 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
275 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.75 
 
 
280 aa  126  4e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
275 aa  126  4e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6456  ABC transporter permease  34.83 
 
 
258 aa  126  4e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
275 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
324 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488095  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
324 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
324 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16930  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  35.47 
 
 
322 aa  125  8e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
275 aa  125  8e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197989  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
256 aa  125  8e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16627  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
321 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
289 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0080  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.4 
 
 
318 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
264 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  33.05 
 
 
283 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  33.05 
 
 
253 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  33.05 
 
 
285 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  30.34 
 
 
282 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5087  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
259 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  33.06 
 
 
275 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  33.05 
 
 
283 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  33.05 
 
 
283 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  33.06 
 
 
275 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  33.05 
 
 
253 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  33.06 
 
 
275 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  32.65 
 
 
272 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
281 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.18671e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
265 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
320 aa  122  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 
285 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4207  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  32.1 
 
 
289 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
273 aa  122  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
282 aa  122  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  32.65 
 
 
275 aa  122  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  33.06 
 
 
275 aa  122  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
253 aa  122  8e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
289 aa  122  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.67 
 
 
268 aa  121  1e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.52 
 
 
279 aa  121  1e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  34.36 
 
 
275 aa  121  1e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
281 aa  121  2e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.62 
 
 
301 aa  120  2e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
289 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  33.47 
 
 
275 aa  119  5e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
273 aa  119  5e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
301 aa  119  5e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
254 aa  119  5e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
273 aa  119  5e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
273 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.63 
 
 
279 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.7 
 
 
277 aa  119  8e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>