88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1328 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1328  transcriptional antiterminator, BglG  100 
 
 		 278 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172208  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1406  transcriptional antiterminator, BglG  74.09 
 
 		 276 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0759  transcriptional antiterminator, BglG  60.65 
 
 		 278 aa  362  4e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  46.38 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  45.99 
 
 		 283 aa  258  7e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2440  transcriptional antiterminator, BglG  45.62 
 
 		 287 aa  256  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000609251  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2743  transcriptional antiterminator, BglG  45.62 
 
 		 287 aa  255  6e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00574761  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1666  transcriptional antiterminator, BglG  44.93 
 
 		 284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000414905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  43.59 
 
 		 276 aa  251  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  42.65 
 
 		 280 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0876  BigG family transcription antiterminator  43.07 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0858  BglG family transcriptional antiterminator  42.7 
 
 		 282 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753628  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  39.05 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  39.05 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4271  transcriptional antiterminator BglG  38.69 
 
 		 278 aa  225  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3937  transcriptional antiterminator BglG  38.69 
 
 		 278 aa  225  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4233  transcriptional antiterminator BglG  38.69 
 
 		 278 aa  225  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4244  transcriptional antiterminator, BglG  38.69 
 
 		 278 aa  225  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2549  transcriptional antiterminator, BglG  38.35 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  37.73 
 
 		 311 aa  215  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  37.73 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  37.23 
 
 		 279 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3966  transcriptional antiterminator, BglG  37 
 
 		 278 aa  201  8e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  35.87 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1546  beta-glucoside operon antiterminator  35.9 
 
 		 284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3469  transcriptional antiterminator, BglG  39.27 
 
 		 285 aa  198  7e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  37 
 
 		 276 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0762  transcriptional antiterminator, BglG  33.7 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0900  beta-glucoside operon antiterminator  34.28 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1354  transcriptional antiterminator, BglG  34.77 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0746  transcriptional antiterminator, BglG  32.97 
 
 		 289 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1890  transcriptional antiterminator, BglG  34.67 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0093026  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0789  transcriptional antiterminator LicT  33.33 
 
 		 283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1347  transcriptional antiterminator, BglG  32.12 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1049  transcriptional antiterminator, BglG  34.43 
 
 		 276 aa  178  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0473  transcriptional antiterminator, BglG  35.66 
 
 		 282 aa  176  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0915311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  32.36 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  34.2 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  32.84 
 
 		 282 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  32.84 
 
 		 282 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  33.21 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  32.73 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  32.84 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  32.73 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  32.84 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  32.73 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  32.84 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  32.36 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0888  transcriptional antiterminator, BglG  31.64 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1758  beta-glucoside operon antiterminator  31.39 
 
 		 279 aa  155  7e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.798018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  30.77 
 
 		 282 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  29.52 
 
 		 285 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1670  transcriptional antiterminator  31.77 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0701104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4205  cryptic beta-glucoside bgl operon antiterminator  42.42 
 
 		 164 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1460  transcriptional antiterminator, BglG  28.16 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000872173  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2962  putative transcriptional antiterminator  30.55 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  30.5 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  30.5 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0928  transcriptional antiterminator LicT, putative  28.32 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  29.15 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  26.91 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  26.91 
 
 		 282 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  27.9 
 
 		 281 aa  118  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0341  beta-glucoside operon antiterminator  24.22 
 
 		 304 aa  102  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223253  hitchhiker  0.0000011111 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0499  beta-glucoside operon antiterminator  26.26 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000340266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2133  PTS system transcriptional activator  30.83 
 
 		 892 aa  68.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5437  BigG family transcription antiterminator  31.62 
 
 		 891 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.250784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5052  BigG family transcription antiterminator  31.62 
 
 		 891 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.309517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4882  transcriptional antiterminator  31.62 
 
 		 891 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4897  transcriptional antiterminator  31.62 
 
 		 891 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0871125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5314  BigG family transcription antiterminator  31.62 
 
 		 550 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5369  transcription antiterminator, BglG family  31.62 
 
 		 891 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000331131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5293  transcription antiterminator, BglG family  31.62 
 
 		 891 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211456 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5635  transcription antiterminator, BglG family  34.44 
 
 		 891 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396867  hitchhiker  0.00000000250243 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4997  PTS system transcriptional activator  34.44 
 
 		 892 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5324  transcription antiterminator, BglG family  33.33 
 
 		 891 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3748  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  32.95 
 
 		 897 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00968283  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  32.04 
 
 		 646 aa  56.6  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  32 
 
 		 977 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  29.63 
 
 		 661 aa  52.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  30.93 
 
 		 692 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.3 
 
 		 696 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  30 
 
 		 652 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0261  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  24.27 
 
 		 901 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  26.67 
 
 		 741 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  22.8 
 
 		 705 aa  46.6  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  27.5 
 
 		 680 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  29.73 
 
 		 625 aa  43.9  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>