83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_01060 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_01060  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  336  9e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0159  hypothetical protein  98.81 
 
 
169 aa  328  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2328  GPW/gp25 family protein  72.02 
 
 
170 aa  249  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0349509 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4087  type VI secretion system lysozyme-related protein  52.15 
 
 
184 aa  153  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.92593e-09 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0526  type VI secretion system lysozyme-related protein  45.73 
 
 
171 aa  141  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  48.73 
 
 
167 aa  140  1e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3010  GPW/gp25 family protein  45.68 
 
 
191 aa  129  2e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.50496  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0197  type VI secretion system lysozyme-related protein  43.4 
 
 
175 aa  120  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  45.06 
 
 
182 aa  120  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  45.57 
 
 
186 aa  119  2e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1479  hypothetical protein  44.1 
 
 
173 aa  118  4e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3858  type VI secretion system lysozyme-related protein  43.23 
 
 
184 aa  116  2e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229758  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  43.03 
 
 
178 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  43.03 
 
 
182 aa  114  8e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  43.03 
 
 
186 aa  114  9e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  43.03 
 
 
186 aa  114  9e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  43.03 
 
 
186 aa  114  9e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  43.03 
 
 
186 aa  114  9e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  43.03 
 
 
186 aa  114  9e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2452  type VI secretion system lysozyme-related protein  40.49 
 
 
191 aa  113  1e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480301  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6118  type VI secretion system lysozyme-related protein  40.76 
 
 
183 aa  109  2e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590599  normal  0.324873 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0976  hypothetical protein  39.38 
 
 
190 aa  107  9e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3470  hypothetical protein  41.14 
 
 
185 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26640  hypothetical protein  43.31 
 
 
180 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.54439  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3904  type VI secretion system lysozyme-related protein  39.49 
 
 
188 aa  103  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.705999 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1203  hypothetical protein  38.71 
 
 
193 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0916  hypothetical protein  38.71 
 
 
193 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.677867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2178  hypothetical protein  38.71 
 
 
193 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1905  hypothetical protein  38.71 
 
 
193 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.182169  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0247  hypothetical protein  38.71 
 
 
193 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1699  hypothetical protein  38.71 
 
 
193 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0338  hypothetical protein  38.06 
 
 
193 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1689  type VI secretion system lysozyme-related protein  38.06 
 
 
173 aa  94  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4432  hypothetical protein  36.94 
 
 
176 aa  92  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0945  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.38 
 
 
178 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6690  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.82 
 
 
173 aa  81.6  4e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0173  hypothetical protein  39.6 
 
 
172 aa  81.3  7e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1622  hypothetical protein  39.6 
 
 
172 aa  81.3  7e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0151  hypothetical protein  39.6 
 
 
172 aa  81.3  7e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0307  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.02 
 
 
164 aa  80.1  1e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0292  hypothetical protein  36.02 
 
 
164 aa  80.1  1e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.871177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0294  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.02 
 
 
164 aa  80.1  1e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.214716 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0299  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.02 
 
 
164 aa  79.7  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.828471  normal  0.298801 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3011  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.18 
 
 
173 aa  80.1  2e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0617913  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0137  hypothetical protein  36.91 
 
 
172 aa  78.2  5e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3124  GPW/gp25 family protein  37.24 
 
 
235 aa  75.9  2e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0142629  normal  0.0780049 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3480  hypothetical protein  37.24 
 
 
235 aa  75.9  2e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426871  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  38.69 
 
 
159 aa  68.2  5e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2446  hypothetical protein  45.98 
 
 
248 aa  67  1e-10  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0240156  normal  0.711628 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.96 
 
 
161 aa  66.2  2e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.96 
 
 
161 aa  65.9  2e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  37.96 
 
 
161 aa  65.9  2e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  37.96 
 
 
161 aa  65.9  2e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  37.96 
 
 
161 aa  65.9  2e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.96 
 
 
161 aa  65.9  3e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2174  hypothetical protein  39.26 
 
 
159 aa  65.1  5e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.67459e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  37.23 
 
 
161 aa  64.3  7e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  37.96 
 
 
160 aa  64.3  8e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  37.96 
 
 
160 aa  64.3  8e-10  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  37.96 
 
 
160 aa  64.3  8e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  37.96 
 
 
160 aa  64.3  8e-10  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  37.96 
 
 
160 aa  64.3  8e-10  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  37.96 
 
 
160 aa  64.3  8e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  38.69 
 
 
160 aa  63.9  9e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  37.78 
 
 
157 aa  63.5  1e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1490  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.79 
 
 
159 aa  62.4  3e-09  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.237539  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1930  hypothetical protein  31.79 
 
 
159 aa  62.4  3e-09  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.180626  normal  0.25956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1378  hypothetical protein  31.79 
 
 
159 aa  62.4  3e-09  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2365  hypothetical protein  31.82 
 
 
154 aa  57.8  7e-08  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  32.85 
 
 
162 aa  52.8  3e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3075  GPW/gp25 family protein  35.88 
 
 
173 aa  52  4e-06  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  30.56 
 
 
165 aa  52  4e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3040  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.26 
 
 
159 aa  50.8  8e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2270  hypothetical protein  32.89 
 
 
160 aa  49.7  2e-05  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2766  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.43 
 
 
160 aa  49.7  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0113374  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2624  GPW/gp25 family protein  30.43 
 
 
160 aa  49.3  2e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3098  hypothetical protein  30.43 
 
 
160 aa  49.3  2e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2508  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.43 
 
 
160 aa  50.1  2e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2363  type VI secretion system lysozyme-related protein  26.9 
 
 
182 aa  49.3  3e-05  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1210  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.92 
 
 
145 aa  48.1  6e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3029  hypothetical protein  29.19 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0316867  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3039  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.13 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000024  uncharacterized protein ImpF  30.93 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>