60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3040 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3040  type VI secretion system lysozyme-related protein  100 
 
 		 159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1210  type VI secretion system lysozyme-related protein  91.03 
 
 		 145 aa  268  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  40.4 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3075  GPW/gp25 family protein  40.68 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.58 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2270  hypothetical protein  36.05 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.07 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  30.32 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  32.28 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  32.28 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.28 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  32.28 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  31.61 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  31.61 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  31.61 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  31.61 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  31.61 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  31.61 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.86 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2365  hypothetical protein  32.37 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  33.86 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6047  hypothetical protein  31.65 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183356  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3029  hypothetical protein  34.81 
 
 		 180 aa  60.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0316867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  30.52 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2174  hypothetical protein  33.85 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000567459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  31.76 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000024  uncharacterized protein ImpF  29.93 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50830  hypothetical protein  36.45 
 
 		 150 aa  51.2  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01060  hypothetical protein  32.26 
 
 		 169 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2766  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.89 
 
 		 160 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0113374  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3409  hypothetical protein  34.58 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2446  hypothetical protein  32.63 
 
 		 248 aa  48.5  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0240156  normal  0.711628 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3098  hypothetical protein  30.65 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2508  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.65 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2624  GPW/gp25 family protein  30.65 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  28.12 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0159  hypothetical protein  31.61 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  29.63 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  29.63 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5981  type VI secretion system lysozyme-related protein  38 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4087  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.16 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000692593 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  29.63 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  29.63 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  29.63 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  29.63 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  29.63 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  27.56 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3480  hypothetical protein  31.11 
 
 		 235 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426871  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3124  GPW/gp25 family protein  31.11 
 
 		 235 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0142629  normal  0.0780049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4955  hypothetical protein  27.64 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  31.65 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2328  GPW/gp25 family protein  27.45 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0349509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0197  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.48 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1676  hypothetical protein  28.3 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0537  hypothetical protein  28.33 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2126  hypothetical protein  28.33 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2028  hypothetical protein  28.33 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0607  hypothetical protein  27.67 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0741  hypothetical protein  27.67 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228212  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0718  hypothetical protein  27.67 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>