50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1210 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1210  type VI secretion system lysozyme-related protein  100 
 
 		 145 aa  292  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3040  type VI secretion system lysozyme-related protein  91.03 
 
 		 159 aa  268  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3075  GPW/gp25 family protein  39.32 
 
 		 173 aa  73.6  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  29.87 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  31.17 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  31.17 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  31.17 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  31.17 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  31.17 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  31.17 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.06 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  31.5 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  31.5 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.5 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  31.5 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.5 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.07 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2365  hypothetical protein  32.59 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  32.28 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2270  hypothetical protein  33.56 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  32.79 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2174  hypothetical protein  33.85 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000567459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3029  hypothetical protein  36.44 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0316867  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  31.2 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6047  hypothetical protein  28.77 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2766  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.08 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0113374  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50830  hypothetical protein  35.51 
 
 		 150 aa  50.1  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000024  uncharacterized protein ImpF  26.32 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01060  hypothetical protein  29.92 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2624  GPW/gp25 family protein  29.84 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  29.49 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2508  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.84 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3098  hypothetical protein  29.84 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  27.56 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2446  hypothetical protein  32.63 
 
 		 248 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0240156  normal  0.711628 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  27.34 
 
 		 186 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  27.34 
 
 		 186 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  27.34 
 
 		 186 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  27.34 
 
 		 186 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  27.34 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  27.34 
 
 		 186 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  27.34 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3409  hypothetical protein  32.41 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3124  GPW/gp25 family protein  30 
 
 		 235 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0142629  normal  0.0780049 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3480  hypothetical protein  30 
 
 		 235 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426871  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  30.26 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4955  hypothetical protein  28.23 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5981  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.99 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0159  hypothetical protein  30 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>