More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_11091 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_11091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
331 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.147095  normal  0.740679 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0670  ribose-phosphate pyrophosphokinase  88.52 
 
 
331 aa  607  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00572245  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15031  ribose-phosphate pyrophosphokinase  88.52 
 
 
331 aa  607  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11701  ribose-phosphate pyrophosphokinase  84.89 
 
 
331 aa  581  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11871  ribose-phosphate pyrophosphokinase  83.99 
 
 
331 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11861  ribose-phosphate pyrophosphokinase  83.38 
 
 
331 aa  577  1e-164  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.669789  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  83.69 
 
 
337 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  82.78 
 
 
331 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  83.08 
 
 
331 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.319247  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  80.36 
 
 
331 aa  558  1e-158  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  74.84 
 
 
331 aa  505  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  74.2 
 
 
338 aa  497  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.06 
 
 
338 aa  489  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.29 
 
 
318 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.03 
 
 
330 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.29 
 
 
318 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.66 
 
 
330 aa  471  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.75 
 
 
330 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.86 
 
 
322 aa  362  5.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.95 
 
 
318 aa  361  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
317 aa  359  4e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  54.34 
 
 
317 aa  358  5e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.99 
 
 
314 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.18 
 
 
322 aa  353  2.9999999999999997e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.02 
 
 
313 aa  352  4e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.85 
 
 
315 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.63 
 
 
316 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  54.29 
 
 
326 aa  348  7e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.55 
 
 
316 aa  339  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
315 aa  339  5e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
317 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
317 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
317 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
317 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
317 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
317 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
317 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
317 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
317 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
317 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
319 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.07 
 
 
317 aa  335  7e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.56 
 
 
315 aa  334  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.1 
 
 
325 aa  333  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.69 
 
 
319 aa  333  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.41 
 
 
309 aa  332  5e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  53.55 
 
 
312 aa  332  6e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
316 aa  332  8e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.45 
 
 
309 aa  331  1e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.15 
 
 
359 aa  331  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.56 
 
 
315 aa  331  1e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1558  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.05 
 
 
312 aa  331  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.27 
 
 
318 aa  330  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.48 
 
 
311 aa  330  2e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.41 
 
 
315 aa  329  4e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.9 
 
 
312 aa  328  9e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000644395 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.8 
 
 
309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1451  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.45 
 
 
315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.212954  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
314 aa  326  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0692  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.6 
 
 
315 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3550  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.6 
 
 
315 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.61 
 
 
313 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3741  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.6 
 
 
315 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3618  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.6 
 
 
315 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.294091  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.8 
 
 
332 aa  325  6e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
314 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3837  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.45 
 
 
315 aa  324  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
309 aa  324  1e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3173  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.45 
 
 
315 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283101  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0793  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.45 
 
 
315 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000256168  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0797  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.45 
 
 
315 aa  324  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97766  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0765  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.45 
 
 
315 aa  324  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
318 aa  324  2e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  49.68 
 
 
313 aa  323  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.13 
 
 
315 aa  323  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 
309 aa  322  6e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 
315 aa  322  6e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
314 aa  322  6e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
325 aa  322  8e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.8 
 
 
314 aa  321  9.000000000000001e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.44 
 
 
329 aa  321  9.000000000000001e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
324 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000010971  normal  0.440092 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0719  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.96 
 
 
315 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196966  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
315 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.48 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.56 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.36 
 
 
316 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.36 
 
 
316 aa  319  5e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
314 aa  319  5e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 
315 aa  318  6e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.092676  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.53 
 
 
320 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.53 
 
 
320 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.53 
 
 
320 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.53 
 
 
320 aa  318  7e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3557  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 
314 aa  318  7.999999999999999e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00334731  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1312  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 
315 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01192  hypothetical protein  49.2 
 
 
315 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.332422  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2419  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 
315 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0172206  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1355  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 
315 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000522341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>