32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4325 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4325  chondroitin AC lyase  100 
 
 		 693 aa  1414    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0786  polysaccharide lyase family 8  30.61 
 
 		 700 aa  291  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3863  Chondroitin AC lyase  28.82 
 
 		 656 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.569924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3979  polysaccharide lyase family 8  28.59 
 
 		 718 aa  261  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0500  polysaccharide lyase family 8  35.56 
 
 		 533 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346359  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.05 
 
 		 929 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3227  Hyaluronate lyase  27.96 
 
 		 1131 aa  157  9e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4980  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  25.58 
 
 		 797 aa  140  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00611188  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0850  Hyaluronate lyase  27.94 
 
 		 792 aa  131  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4208  Hyaluronate lyase  29.17 
 
 		 753 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431721  hitchhiker  0.000853972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1698  hyaluronate lyase  27.49 
 
 		 793 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6725  Hyaluronate lyase  27.59 
 
 		 576 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7449  hypothetical protein  34.14 
 
 		 636 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0352  hyaluronate lyase  23.63 
 
 		 791 aa  107  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0394  polysaccharide lyase family protein 8  23.29 
 
 		 1003 aa  107  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0390  polysaccharide lyase family protein 8  22.98 
 
 		 985 aa  104  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.918566  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0932  polysaccharide lyase family protein 8  26.17 
 
 		 750 aa  89  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0363871  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0174  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  24.51 
 
 		 846 aa  79  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0125  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  20.36 
 
 		 739 aa  77.4  0.0000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2232  polysaccharide lyase family protein 8  21.43 
 
 		 809 aa  76.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2271  polysaccharide lyase family protein 8  21.43 
 
 		 809 aa  76.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1197  hyaluronate lyase  22.16 
 
 		 1072 aa  74.7  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4062  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  25.32 
 
 		 892 aa  73.9  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.505411  normal  0.685622 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2840  polysaccharide lyase family 8  25.86 
 
 		 989 aa  71.2  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.109346  normal  0.0108324 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0117  Hyaluronate lyase  20.59 
 
 		 618 aa  62.8  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0784  Lyase catalytic  23.22 
 
 		 1030 aa  58.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0997  lyase catalytic  24.82 
 
 		 1024 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0946  polysaccharide lyase family protein 8  24.82 
 
 		 1024 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2256  chondroitinase  27.56 
 
 		 1043 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824242 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3277  polysaccharide lyase family protein 8  24.57 
 
 		 1024 aa  50.8  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2838  Lyase catalytic  23.29 
 
 		 1077 aa  45.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102032 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1414  extracellular solute-binding protein family 5  30.86 
 
 		 636 aa  44.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>