More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_34104 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009357  OSTLU_34104  predicted protein  100 
 
 		 746 aa  1551    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.121587 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81289  cysteinyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 776 aa  462  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.000000312189 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26346  predicted protein  43.66 
 
 		 647 aa  435  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.607128  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00900  cysteine-tRNA ligase, putative  37.74 
 
 		 785 aa  397  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.151967  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08800  cysteinyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G09610)  34.15 
 
 		 833 aa  387  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.514684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  29.76 
 
 		 466 aa  254  6e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 		 489 aa  253  6e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 		 484 aa  253  7e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 		 505 aa  252  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 		 460 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 461 aa  250  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 461 aa  251  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  33.61 
 
 		 461 aa  250  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 461 aa  250  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 461 aa  250  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 461 aa  250  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 		 460 aa  251  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 461 aa  250  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 461 aa  250  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 		 460 aa  250  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 459 aa  249  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 		 460 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 		 460 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 		 461 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  31.56 
 
 		 460 aa  246  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  30.74 
 
 		 485 aa  246  9e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  31.27 
 
 		 460 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 		 459 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 472 aa  244  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0583  cysteinyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000237473  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 459 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 		 460 aa  242  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 476 aa  241  5e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01977  cysteinyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 460 aa  239  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 465 aa  238  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2221  cysteinyl-tRNA synthetase  30.68 
 
 		 462 aa  238  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.312209  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 		 465 aa  238  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1875  cysteinyl-tRNA synthetase  30.68 
 
 		 462 aa  238  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000229747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 488 aa  238  4e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2510  cysteinyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 		 465 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390951  hitchhiker  0.00182498 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 475 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1825  cysteinyl-tRNA synthetase  30.15 
 
 		 498 aa  236  8e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 488 aa  236  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0919  cysteinyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 456 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 		 462 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 		 459 aa  234  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 476 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  30.9 
 
 		 467 aa  233  1e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1085  cysteinyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 491 aa  231  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189428  normal  0.0293604 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 493 aa  231  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2507  cysteinyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 461 aa  230  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 465 aa  229  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 461 aa  229  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  30.1 
 
 		 466 aa  228  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  30.1 
 
 		 466 aa  228  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  30.68 
 
 		 459 aa  228  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 473 aa  228  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.969575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1167  cysteinyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 465 aa  227  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 476 aa  226  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 		 461 aa  226  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 		 481 aa  226  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  31.6 
 
 		 479 aa  226  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1941  cysteinyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 		 465 aa  225  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 		 466 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 459 aa  224  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3600  cysteinyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 		 498 aa  224  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 453 aa  223  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1203  cysteinyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 465 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0892832  normal  0.183053 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1656  cysteinyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 		 465 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000728192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1432  cysteinyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 		 465 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2681  cysteinyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 		 465 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2545  cysteinyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 		 465 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2159  cysteinyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 		 465 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3156  cysteinyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 		 465 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.719949  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0730  cysteinyl-tRNA synthetase  30.51 
 
 		 487 aa  222  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2596  cysteinyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 		 465 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0629177  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 		 459 aa  221  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3498  cysteinyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 		 472 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1153  cysteinyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 457 aa  221  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.102155  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 		 466 aa  219  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0855  cysteinyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 488 aa  219  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  35.81 
 
 		 497 aa  219  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 		 499 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 		 465 aa  219  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 		 479 aa  219  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1488  cysteinyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 482 aa  219  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1623  cysteinyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2611  cysteinyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 505 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.536822  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 		 474 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 498 aa  218  4e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 		 447 aa  218  5e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1228  cysteinyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 477 aa  218  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2091  cysteinyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 458 aa  217  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 447 aa  217  5.9999999999999996e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1380  cysteinyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 486 aa  216  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.461821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1184  cysteinyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 		 463 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.257527  normal  0.696826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>