More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0616 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0616  pirin  100 
 
 
293 aa  588  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  90.21 
 
 
288 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  72.38 
 
 
288 aa  428  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  72.38 
 
 
288 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  73.08 
 
 
288 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  72.73 
 
 
288 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  73.08 
 
 
288 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  72.73 
 
 
288 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  73.08 
 
 
288 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  69.58 
 
 
288 aa  411  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  68.88 
 
 
288 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  68.88 
 
 
288 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  68.88 
 
 
288 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  68.88 
 
 
288 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  68.88 
 
 
288 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  68.88 
 
 
288 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  68.88 
 
 
288 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  66.78 
 
 
288 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  70.49 
 
 
290 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  67.13 
 
 
288 aa  403  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  67.82 
 
 
293 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  66.78 
 
 
305 aa  398  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  65.64 
 
 
292 aa  397  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  64.11 
 
 
289 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  65.38 
 
 
293 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  64.11 
 
 
289 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  66.43 
 
 
288 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  64.69 
 
 
293 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  64.11 
 
 
289 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  62.94 
 
 
288 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  64.34 
 
 
293 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  65.38 
 
 
290 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  61.89 
 
 
286 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  61.54 
 
 
286 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  61.54 
 
 
286 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  65.37 
 
 
286 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  61.89 
 
 
286 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  61.89 
 
 
286 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  65.02 
 
 
303 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  64.66 
 
 
286 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  60.41 
 
 
295 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  59.73 
 
 
295 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  60.07 
 
 
295 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  61.89 
 
 
291 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  59.25 
 
 
290 aa  351  7e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  57.89 
 
 
287 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  55.09 
 
 
286 aa  334  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  50.52 
 
 
287 aa  306  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4059  Pirin domain protein  50 
 
 
290 aa  302  5.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  49.13 
 
 
293 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42930  predicted protein  47.21 
 
 
311 aa  263  3e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1938  pirin family protein  48.1 
 
 
288 aa  261  1e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0765198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  50.37 
 
 
286 aa  258  9e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  44.44 
 
 
290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  44.81 
 
 
290 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  44.81 
 
 
290 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  44.81 
 
 
290 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  43.33 
 
 
290 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  44.81 
 
 
290 aa  208  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  44.28 
 
 
292 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  43.12 
 
 
290 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  43.12 
 
 
290 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  43.12 
 
 
290 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  43.12 
 
 
290 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  43.12 
 
 
290 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  43.12 
 
 
290 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  44.07 
 
 
290 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  42.7 
 
 
318 aa  202  6e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  43.48 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  43.58 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  43.7 
 
 
290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  41.6 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  41.69 
 
 
324 aa  195  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  43.53 
 
 
346 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  42.29 
 
 
322 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  41.6 
 
 
282 aa  192  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  40.6 
 
 
331 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  43.73 
 
 
322 aa  189  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0747  pirin domain-containing protein  41.02 
 
 
324 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.989283  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  42.29 
 
 
286 aa  188  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6985  Pirin domain protein  39.53 
 
 
287 aa  189  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16689  hitchhiker  0.00000014497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  42.44 
 
 
292 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00280  Pirin-related protein  40.14 
 
 
342 aa  187  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0074  pirin domain-containing protein  42.19 
 
 
328 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416203  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0093  pirin domain-containing protein  42.19 
 
 
328 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28108  normal  0.0211992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0084  Pirin-like protein  42.19 
 
 
328 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  38.08 
 
 
328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  40.92 
 
 
337 aa  183  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  38.36 
 
 
315 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  39.65 
 
 
288 aa  181  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  41.99 
 
 
320 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  44.61 
 
 
279 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5014  Pirin domain protein  36.43 
 
 
286 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  38.97 
 
 
294 aa  171  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  40.56 
 
 
299 aa  171  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0677  hypothetical protein  33.98 
 
 
293 aa  170  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  39.44 
 
 
279 aa  169  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  43.64 
 
 
286 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  43.64 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  43.61 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>