102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0577 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  621  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  92.36 
 
 
323 aa  578  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  83.44 
 
 
323 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  76.75 
 
 
319 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  79.94 
 
 
326 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  75.8 
 
 
328 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  78.03 
 
 
327 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  45.54 
 
 
333 aa  275  6e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  45.54 
 
 
333 aa  275  6e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  44.27 
 
 
347 aa  268  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  48.98 
 
 
343 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  45.64 
 
 
322 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  47.1 
 
 
317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  46.71 
 
 
329 aa  250  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  51.23 
 
 
349 aa  248  7e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  47.33 
 
 
326 aa  233  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  47.33 
 
 
326 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  46.33 
 
 
323 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  39.55 
 
 
337 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  39.68 
 
 
337 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  46.08 
 
 
316 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  46.21 
 
 
333 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  41.53 
 
 
339 aa  222  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  38.54 
 
 
316 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  34.58 
 
 
324 aa  207  1e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  37.33 
 
 
327 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  35.92 
 
 
298 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  31.85 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  33.33 
 
 
297 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  35.04 
 
 
297 aa  109  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  30.8 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  30.07 
 
 
300 aa  92.4  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  31.86 
 
 
303 aa  92.4  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  33.15 
 
 
309 aa  84  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  32.12 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  32.12 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  32.02 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  31.31 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  34.55 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  25.32 
 
 
301 aa  60.1  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03311  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  28.44 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0253  protein insertion ABC transporter, inner membrane subunit FtsX  28.44 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3661  cell division protein FtsX  28.44 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3944  cell division protein FtsX  28.44 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0254  cell division protein FtsX  28.44 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3745  cell division protein FtsX  28.44 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3860  cell division protein FtsX  28.44 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4782  cell division protein FtsX  28.44 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03264  hypothetical protein  28.44 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  24.81 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  24.06 
 
 
341 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  27.07 
 
 
351 aa  57  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  24.06 
 
 
341 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  25.84 
 
 
317 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0223  cell division protein FtsX  25.09 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0710231 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  25.84 
 
 
317 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  25.84 
 
 
317 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3838  cell division protein FtsX  24 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3881  cell division protein FtsX  24 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3761  cell division protein FtsX  24 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3771  cell division protein FtsX  24 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3940  cell division protein FtsX  24 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  24.45 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0160  putative cell division permease protein FtsX  22.09 
 
 
324 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3071  protein of unknown function DUF214  31.21 
 
 
345 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0933054  normal  0.0269654 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4977  hypothetical protein  23.38 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  23.31 
 
 
341 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5301  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  23.25 
 
 
297 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3722  hypothetical protein  22.51 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5655  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  23.25 
 
 
275 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0095  cell division protein FtsX  27.19 
 
 
322 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1855  cell division protein FtsX  23.86 
 
 
316 aa  50.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.393875  normal  0.417325 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0058  cell division protein FtsX  21.37 
 
 
316 aa  50.1  0.00005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.105068  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0101  cell division protein FtsX  27.19 
 
 
322 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270699  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5033  cell division ABC transporter permease FtsX  22.88 
 
 
297 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4863  cell division ABC transporter, permease  22.88 
 
 
297 aa  49.7  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4878  cell division ABC transporter, permease  22.88 
 
 
297 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5335  cell division protein FtsX  22.36 
 
 
341 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420624  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5415  cell division ABC transporter permease protein FtsX  22.88 
 
 
297 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1553  cell division protein FtsX  22.22 
 
 
312 aa  49.7  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.119843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5271  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  22.88 
 
 
297 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1705  protein of unknown function DUF214  23.11 
 
 
290 aa  49.3  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.702845  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5289  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  22.88 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1769  protein of unknown function DUF214  21.79 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00766371  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5346  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  22.88 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4741  protein of unknown function DUF214  23.58 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4749  hypothetical protein  22.76 
 
 
344 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0968947  normal  0.0457706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04920  cell division protein FtsX  22.03 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123508  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1047  hypothetical protein  20.24 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0188433  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0527  cell division protein, putative  24.48 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000882994  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2372  cell division protein FtsX  25 
 
 
330 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000210413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0470  cell division protein FtsX  22.03 
 
 
335 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3875  cell division protein FtsX  26.89 
 
 
323 aa  47  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.939193  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3607  cell division protein FtsX  22.58 
 
 
333 aa  46.6  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00806007  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1605  cell division protein FtsX  35.16 
 
 
295 aa  46.2  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.081685  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1675  cell division protein  22.22 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0429  putative protein insertion permease FtsX  21.95 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2901  cell division protein FtsX  22.73 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1774  cell division ABC transporter, permease protein FtsX, putative  21.55 
 
 
316 aa  43.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0135  protein insertion permease FtsX, putative  25.88 
 
 
300 aa  42.7  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>