77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2194 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  87.07 
 
 
317 aa  495  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  72.76 
 
 
322 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  75.33 
 
 
326 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  75.33 
 
 
326 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  75.08 
 
 
323 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  58.28 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  49.67 
 
 
343 aa  270  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  48.38 
 
 
323 aa  256  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  46.08 
 
 
314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  44.86 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  44.86 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  48.83 
 
 
319 aa  242  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  48.01 
 
 
323 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  43.84 
 
 
347 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  40.95 
 
 
337 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  45.48 
 
 
329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  39.75 
 
 
337 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  41.5 
 
 
316 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  49.1 
 
 
327 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  48.74 
 
 
326 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  44.08 
 
 
328 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  42.76 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  44.1 
 
 
333 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  35.62 
 
 
324 aa  211  1e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  40.99 
 
 
298 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  37.46 
 
 
327 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  37.26 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  33.68 
 
 
300 aa  116  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  37.21 
 
 
300 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  37.56 
 
 
297 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  37.11 
 
 
300 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  37.11 
 
 
300 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  38.38 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  38.2 
 
 
309 aa  93.6  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  32.34 
 
 
311 aa  90.9  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  39.11 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  33.18 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  33.88 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  32.51 
 
 
301 aa  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3771  cell division protein FtsX  27.27 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3761  cell division protein FtsX  27.27 
 
 
351 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3881  cell division protein FtsX  27.27 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3838  cell division protein FtsX  27.27 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3940  cell division protein FtsX  27.27 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  26.55 
 
 
351 aa  62.8  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  25.44 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  25.44 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  25.44 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0254  cell division protein FtsX  26.64 
 
 
352 aa  57  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3860  cell division protein FtsX  26.64 
 
 
352 aa  57  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4782  cell division protein FtsX  26.64 
 
 
352 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0253  protein insertion ABC transporter, inner membrane subunit FtsX  26.64 
 
 
352 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03264  hypothetical protein  26.64 
 
 
352 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3745  cell division protein FtsX  26.64 
 
 
352 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03311  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  26.64 
 
 
352 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3661  cell division protein FtsX  26.64 
 
 
352 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3944  cell division protein FtsX  26.64 
 
 
352 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0223  cell division protein FtsX  26 
 
 
317 aa  55.8  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0710231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0095  cell division protein FtsX  24.62 
 
 
322 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  25.09 
 
 
321 aa  53.1  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3875  cell division protein FtsX  28.78 
 
 
323 aa  53.1  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.939193  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1553  cell division protein FtsX  21.94 
 
 
312 aa  52  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.119843  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0101  cell division protein FtsX  24.12 
 
 
322 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270699  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3071  protein of unknown function DUF214  29.27 
 
 
345 aa  50.8  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0933054  normal  0.0269654 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0135  protein insertion permease FtsX, putative  26.86 
 
 
300 aa  46.6  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108648  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0058  cell division protein FtsX  21.51 
 
 
316 aa  45.8  0.0008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.105068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1855  cell division protein FtsX  23.94 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.393875  normal  0.417325 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0711  hypothetical protein  30.3 
 
 
294 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  31.91 
 
 
341 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  30.84 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0160  putative cell division permease protein FtsX  23.62 
 
 
324 aa  43.9  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  31.22 
 
 
341 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  28.19 
 
 
330 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1705  protein of unknown function DUF214  24.24 
 
 
290 aa  43.1  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.702845  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  29.95 
 
 
341 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0427  cell division protein, putative  26.53 
 
 
295 aa  42.4  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000233953  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>