48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4028 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  100 
 
 		 316 aa  635    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  78.91 
 
 		 337 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  78.91 
 
 		 337 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  75.48 
 
 		 339 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  58.47 
 
 		 347 aa  363  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  59.86 
 
 		 333 aa  362  4e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  59.86 
 
 		 333 aa  362  4e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  56.67 
 
 		 329 aa  334  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  46.28 
 
 		 324 aa  292  5e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  40.34 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  39.33 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  41.89 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  38.54 
 
 		 314 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  43.25 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  41.02 
 
 		 326 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  41.02 
 
 		 326 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  44.71 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  40.86 
 
 		 323 aa  220  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  41.5 
 
 		 316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  39 
 
 		 328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  42.47 
 
 		 349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  38.67 
 
 		 319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  38.33 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  38.33 
 
 		 327 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  39.93 
 
 		 326 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  37.59 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  35.05 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  32.52 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  30.79 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  33.94 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  28.81 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  30.8 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  32.46 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  29.87 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  30.84 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  30.84 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  28.64 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  33.91 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  26.67 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  25.6 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  25.6 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  25.6 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  25.26 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  28.44 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0429  putative protein insertion permease FtsX  26.5 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4749  hypothetical protein  26.37 
 
 		 344 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0968947  normal  0.0457706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  25.64 
 
 		 330 aa  42.7  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5335  cell division protein FtsX  25.42 
 
 		 341 aa  42.4  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420624  normal  0.433178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>